RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495123.5

PKP4-216, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 580 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-216ENST00000495123 SLC25A38Q96DW6 304 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 MMP28Q9H239 520 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 KCNIP1Q9NZI2 227 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 DPM3Q9P2X0 92 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 VPREB3Q9UKI3 123 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6.97□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa6.97□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa6.97□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 TMEM89A2RUT3 159 aa6.97□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 BTBD17A6NE02 478 aa6.97□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 VGLL3A8MV65 326 aa6.97□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 LEUTXA8MZ59 168 aa6.97□□□□□ -1.29
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PKP4-216ENST00000495123 HKR1P10072 659 aa6.97□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 ZNF134P52741 427 aa6.97□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 HLA-DRB3P79483 266 aa6.97□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa6.97□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 FBLN7Q53RD9 439 aa6.97□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa6.97□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 ZNF439Q8NDP4 499 aa6.97□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 OR5R1Q8NH85 324 aa6.97□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 SLC25A46Q96AG3 418 aa6.97□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
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PKP4-216ENST00000495123 C12orf4Q9NQ89 552 aa6.97□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 OR2S2Q9NQN1 319 aa6.97□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 RHBDL2Q9NX52 303 aa6.97□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 ABRACLQ9P1F3 81 aa6.97□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 GNG12Q9UBI6 72 aa6.97□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 SPATA2Q9UM82 520 aa6.97□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 ETV7Q9Y603 341 aa6.97□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 TMEM235A6NFC5 223 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-216ENST00000495123 FCGR3AP08637 254 aa6.96□□□□□ -1.3
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PKP4-216ENST00000495123 CD3GP09693 182 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-216ENST00000495123 CD24P25063 80 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-216ENST00000495123 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PKP4-216ENST00000495123 SCAND1P57086 179 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-216ENST00000495123 AANATQ16613 207 aa6.96□□□□□ -1.3
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PKP4-216ENST00000495123 MORN2Q502X0 79 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-216ENST00000495123 CT45A1Q5HYN5 189 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-216ENST00000495123 MOB1BQ7L9L4 216 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-216ENST00000495123 ZNF554Q86TJ5 538 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-216ENST00000495123 CROCCP3Q8IVE0 287 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-216ENST00000495123 IZUMO1Q8IYV9 350 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-216ENST00000495123 LINC00311Q8N616 119 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-216ENST00000495123 OR10X1Q8NGY0 326 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-216ENST00000495123 CT45A3Q8NHU0 189 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-216ENST00000495123 IL1F10Q8WWZ1 152 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-216ENST00000495123 MAFIPQ8WZ33 124 aa6.96□□□□□ -1.3
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PKP4-216ENST00000495123 C1RLQ9NZP8 487 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-216ENST00000495123 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
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PKP4-216ENST00000495123 TCF19Q9Y242 345 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-216ENST00000495123 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PKP4-216ENST00000495123 JMJD1CQ15652 2540 aa6.95□□□□□ -1.3
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PKP4-216ENST00000495123 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-216ENST00000495123 A0A1W2PPI3 338 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-216ENST00000495123 A6NDX4 124 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-216ENST00000495123 SERPINE3A8MV23 424 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-216ENST00000495123 CHST1O43916 411 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-216ENST00000495123 YPEL1O60688 119 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-216ENST00000495123 TMEM127O75204 238 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-216ENST00000495123 CEACAM3P40198 252 aa6.95□□□□□ -1.3
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PKP4-216ENST00000495123 REG1BP48304 166 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-216ENST00000495123 DYNLT3P51808 116 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-216ENST00000495123 HTD2P86397 168 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-216ENST00000495123 MADCAM1Q13477 382 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-216ENST00000495123 ARFRP1Q13795 201 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-216ENST00000495123 HERPUD1Q15011 391 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-216ENST00000495123 TMEM30BQ3MIR4 351 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-216ENST00000495123 Q3ZCU0 254 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-216ENST00000495123 AWAT1Q58HT5 328 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-216ENST00000495123 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PKP4-216ENST00000495123 TMEM219Q86XT9 240 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-216ENST00000495123 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PKP4-216ENST00000495123 C8orf31Q8N9H6 132 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-216ENST00000495123 DTX3Q8N9I9 347 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-216ENST00000495123 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-216ENST00000495123 TOMM40LQ969M1 308 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-216ENST00000495123 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-216ENST00000495123 RPEQ96AT9 228 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-216ENST00000495123 CREB3L1Q96BA8 519 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-216ENST00000495123 YPEL2Q96QA6 119 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-216ENST00000495123 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PKP4-216ENST00000495123 DCSTAMPQ9H295 470 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-216ENST00000495123 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
PKP4-216ENST00000495123 OR1A1Q9P1Q5 309 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-216ENST00000495123 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
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