RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478932.1

USP25-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP25, Length 2,605 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-208ENST00000478932 OR3A1P47881 315 aa3.46□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 UCP3P55916 312 aa3.46□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 LINC00205P59089 165 aa3.46□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 SELENOVP59797 346 aa3.46□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 CDSNQ15517 529 aa3.46□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 LTC4SQ16873 150 aa3.46□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 SMIM21Q3B7S5 101 aa3.46□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 KCNRGQ8N5I3 272 aa3.46□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 SPERTQ8NA61 448 aa3.46□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 OR4A4PQ8NGN8 299 aa3.46□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 OR1L1Q8NH94 360 aa3.46□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 MRGPRDQ8TDS7 321 aa3.46□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 ITLN1Q8WWA0 313 aa3.46□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 TMEM222Q9H0R3 208 aa3.46□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 TLNRD1Q9H1K6 362 aa3.46□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 RHOFQ9HBH0 211 aa3.46□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 GCM1Q9NP62 436 aa3.46□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 SHPKQ9UHJ6 478 aa3.46□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 MEMO1Q9Y316 297 aa3.46□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 NAV2Q8IVL1 2488 aa3.46□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 A0A0D9SG52 128 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 A0A1B0GW55 424 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 A0A1B0GWJ7 208 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 NKX2-6A6NCS4 301 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 LEUTXA8MZ59 168 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 SRRM5B3KS81 715 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 GPR31O00270 319 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 OR2F2O95006 317 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 NXPH3O95157 252 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 CDS2O95674 445 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 GLAP06280 429 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 NMBP08949 121 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 OR4A8P0C604 315 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 DUX4L2P0CJ85 424 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 DUX4L3P0CJ86 424 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 DUX4L4P0CJ87 422 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 DUX4L5P0CJ88 424 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 DUX4L6P0CJ89 424 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 DUX4L7P0CJ90 424 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 IGHV3-43DP0DP04 118 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 PTAFRP25105 342 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 F2RP25116 425 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 UCNP55089 124 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 HLA-DRB3P79483 266 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 OR2F1Q13607 317 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 GNMTQ14749 295 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 ADIPOQQ15848 244 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 KRBOX4Q5JUW0 171 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 LCE1DQ5T752 114 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 ZNF880Q6PDB4 577 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 PRSS54Q6PEW0 395 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 SLC51BQ86UW2 128 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 ZNF695Q8IW36 515 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 C1orf174Q8IYL3 243 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 OR52L2PQ8NGH6 319 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 OR13A1Q8NGR1 328 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 PRR7Q8TB68 274 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 ST8SIA2Q92186 375 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 NEUROG1Q92886 237 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 GALMQ96C23 342 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 MEGF10Q96KG7 1140 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 SUCNR1Q9BXA5 334 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 MAGT1Q9H0U3 335 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 OR2S2Q9NQN1 319 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 DUX4Q9UBX2 424 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 FAM181BA6NEQ2 426 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 H7C1Q1 480 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 CCL21O00585 134 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 ST8SIA5O15466 376 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 ZNF737O75373 536 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 IGHV1-46P01743 117 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 HBZP02008 142 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 IL2RGP31785 369 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 ASCL1P50553 236 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 EDDM3BP56851 147 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 RBPJQ06330 500 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 ZNF345Q14585 488 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 CLLU1Q5K131 121 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 UTF1Q5T230 341 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 FAM90A1Q86YD7 464 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 LGI3Q8N145 548 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa3.45□□□□□ -1.86
USP25-208ENST00000478932 OR10V1Q8NGI7 309 aa3.45□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms