RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474188.1

NISCH-206, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-206ENST00000474188 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
NISCH-206ENST00000474188 SERPINA12Q8IW75 414 aa8.41□□□□□ -1.06
NISCH-206ENST00000474188 ODF3L1Q8IXM7 274 aa8.41□□□□□ -1.06
NISCH-206ENST00000474188 OR11H1Q8NG94 326 aa8.41□□□□□ -1.06
NISCH-206ENST00000474188 OR10A7Q8NGE5 316 aa8.41□□□□□ -1.06
NISCH-206ENST00000474188 OR5M8Q8NGP6 311 aa8.41□□□□□ -1.06
NISCH-206ENST00000474188 OR13C5Q8NGS8 318 aa8.41□□□□□ -1.06
NISCH-206ENST00000474188 OR8U1Q8NH10 309 aa8.41□□□□□ -1.06
NISCH-206ENST00000474188 GGHQ92820 318 aa8.41□□□□□ -1.06
NISCH-206ENST00000474188 ARL11Q969Q4 196 aa8.41□□□□□ -1.06
NISCH-206ENST00000474188 OR5B12Q96R08 314 aa8.41□□□□□ -1.06
NISCH-206ENST00000474188 BARHL1Q9BZE3 327 aa8.41□□□□□ -1.06
NISCH-206ENST00000474188 IFT22Q9H7X7 185 aa8.41□□□□□ -1.06
NISCH-206ENST00000474188 VCX3AQ9NNX9 186 aa8.41□□□□□ -1.06
NISCH-206ENST00000474188 TPSG1Q9NRR2 321 aa8.41□□□□□ -1.06
NISCH-206ENST00000474188 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
NISCH-206ENST00000474188 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
NISCH-206ENST00000474188 FBXO7Q9Y3I1 522 aa8.41□□□□□ -1.06
NISCH-206ENST00000474188 WSB1Q9Y6I7 421 aa8.41□□□□□ -1.06
NISCH-206ENST00000474188 H3BMQ9 156 aa8.4□□□□□ -1.06
NISCH-206ENST00000474188 LALBAP00709 142 aa8.4□□□□□ -1.06
NISCH-206ENST00000474188 IGF1P05019 195 aa8.4□□□□□ -1.06
NISCH-206ENST00000474188 LIMS3P0CW19 117 aa8.4□□□□□ -1.06
NISCH-206ENST00000474188 LIMS4P0CW20 117 aa8.4□□□□□ -1.06
NISCH-206ENST00000474188 CD1BP29016 333 aa8.4□□□□□ -1.06
NISCH-206ENST00000474188 ZNF137PP52743 207 aa8.4□□□□□ -1.06
NISCH-206ENST00000474188 GNMTQ14749 295 aa8.4□□□□□ -1.06
NISCH-206ENST00000474188 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
NISCH-206ENST00000474188 C19orf54Q5BKX5 351 aa8.4□□□□□ -1.06
NISCH-206ENST00000474188 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
NISCH-206ENST00000474188 NHLRC3Q5JS37 347 aa8.4□□□□□ -1.06
NISCH-206ENST00000474188 RNLSQ5VYX0 342 aa8.4□□□□□ -1.06
NISCH-206ENST00000474188 SVOPQ8N4V2 548 aa8.4□□□□□ -1.06
NISCH-206ENST00000474188 ZNF491Q8N8L2 437 aa8.4□□□□□ -1.06
NISCH-206ENST00000474188 OR10V1Q8NGI7 309 aa8.4□□□□□ -1.06
NISCH-206ENST00000474188 OR2T10Q8NGZ9 312 aa8.4□□□□□ -1.06
NISCH-206ENST00000474188 OR1L1Q8NH94 360 aa8.4□□□□□ -1.06
NISCH-206ENST00000474188 MUC7Q8TAX7 377 aa8.4□□□□□ -1.06
NISCH-206ENST00000474188 CASTOR1Q8WTX7 329 aa8.4□□□□□ -1.06
NISCH-206ENST00000474188 C4orf3Q8WVX3 66 aa8.4□□□□□ -1.06
NISCH-206ENST00000474188 DCUN1D4Q92564 292 aa8.4□□□□□ -1.06
NISCH-206ENST00000474188 RFKQ969G6 155 aa8.4□□□□□ -1.06
NISCH-206ENST00000474188 YIPF6Q96EC8 236 aa8.4□□□□□ -1.06
NISCH-206ENST00000474188 RCHY1Q96PM5 261 aa8.4□□□□□ -1.06
NISCH-206ENST00000474188 BCL7BQ9BQE9 202 aa8.4□□□□□ -1.06
NISCH-206ENST00000474188 JAM3Q9BX67 310 aa8.4□□□□□ -1.06
NISCH-206ENST00000474188 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
NISCH-206ENST00000474188 ACOT13Q9NPJ3 140 aa8.4□□□□□ -1.06
NISCH-206ENST00000474188 ERVK13-1Q9NX77 482 aa8.4□□□□□ -1.06
NISCH-206ENST00000474188 ST3GAL6Q9Y274 331 aa8.4□□□□□ -1.06
NISCH-206ENST00000474188 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
NISCH-206ENST00000474188 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa8.39□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 FAM90A10PA6NDY2 464 aa8.39□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 MOSP00540 346 aa8.39□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 IGLV1-40P01703 118 aa8.39□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 MAP2K4P45985 399 aa8.39□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 RBM11P57052 281 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 GPR107Q5VW38 600 aa8.39□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 SIGIRRQ6IA17 410 aa8.39□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 ZNF497Q6ZNH5 498 aa8.39□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 AHSA2Q719I0 299 aa8.39□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 HAPLN4Q86UW8 402 aa8.39□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 LYPD6Q86Y78 171 aa8.39□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa8.39□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 GAPTQ8N292 157 aa8.39□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 SYS1Q8N2H4 156 aa8.39□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 C8orf31Q8N9H6 132 aa8.39□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 OR52M1Q8NGK5 317 aa8.39□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 OR52I1Q8NGK6 324 aa8.39□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 OR5D14Q8NGL3 314 aa8.39□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 OR1N2Q8NGR9 330 aa8.39□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 IMPAD1Q9NX62 359 aa8.39□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 IL36GQ9NZH8 169 aa8.39□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 ING4Q9UNL4 249 aa8.39□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 DHDHQ9UQ10 334 aa8.39□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa8.38□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 EFCAB10A6NFE3 127 aa8.38□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 CCDC160A6NGH7 325 aa8.38□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 TMEM212A6NML5 194 aa8.38□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 ATP6V0E1O15342 81 aa8.38□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 GABARAPO95166 117 aa8.38□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa8.38□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 OCM2P0CE71 109 aa8.38□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 SPNP16150 400 aa8.38□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 RAB3AP20336 220 aa8.38□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 KCNJ3P48549 501 aa8.38□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 SLURP1P55000 103 aa8.38□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP8.38□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 RSU1Q15404 277 aa8.38□□□□□ -1.07
NISCH-206ENST00000474188 CTF1Q16619 201 aa8.38□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68 ms