RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467246.5

HPS1-208, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HPS1, Length 2,791 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-208ENST00000467246 SMIM8Q96KF7 97 aa9.64□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 HES4Q9HCC6 221 aa9.64□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 BIN3Q9NQY0 253 aa9.64□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 ZFP57Q9NU63 452 aa9.64□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 NDRG3Q9UGV2 375 aa9.64□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 A6NLC8 198 aa9.64□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 H0Y980 276 aa9.64□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 HSPA12AO43301 675 aa9.64□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 DAOP14920 347 aa9.64□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 PPT1P50897 306 aa9.64□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 CLINT1Q14677 625 aa9.64□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 GNMTQ14749 295 aa9.64□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 P2RY6Q15077 328 aa9.64□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 GPR157Q5UAW9 335 aa9.64□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 UQCC3Q6UW78 93 aa9.64□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 OR10V1Q8NGI7 309 aa9.64□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 EDARADDQ8WWZ3 215 aa9.64□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 C11orf1Q9H5F2 150 aa9.64□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 TAAR3PQ9P1P4 343 aa9.64□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 FAM215AQ9Y5M1 114 aa9.64□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 FAM24AA6NFZ4 105 aa9.63□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 VDAC1P21796 283 aa9.63□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 NBL1P41271 181 aa9.63□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 SULT1A2P50226 295 aa9.63□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 C9orf152Q5JTZ5 239 aa9.63□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 OR5D13Q8NGL4 314 aa9.63□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 ISOC2Q96AB3 205 aa9.63□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 CXXC4Q9H2H0 198 aa9.63□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 MMP26Q9NRE1 261 aa9.63□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 MIOXQ9UGB7 285 aa9.63□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 SLC25A15Q9Y619 301 aa9.63□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 CACNA1DQ01668 2161 aa9.63□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 A0A0G2JRQ6 117 aa9.63□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa9.63□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 SSSCA1O60232 199 aa9.63□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 PSG2P11465 335 aa9.63□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 KITLGP21583 273 aa9.63□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 GCH1P30793 250 aa9.63□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 ZNF718Q3SXZ3 478 aa9.63□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 WDR82Q6UXN9 313 aa9.63□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 MOB1BQ7L9L4 216 aa9.63□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa9.63□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 WIPI2Q9Y4P8 454 aa9.63□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa9.63□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa9.63□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 OR8U9P0C7N5 309 aa9.63□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 CAV2P51636 162 aa9.63□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP9.63□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 AESQ08117 197 aa9.63□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 MSMPQ1L6U9 139 aa9.63□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa9.63□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 BEND4Q6ZU67 534 aa9.63□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 OR2C3Q8N628 320 aa9.63□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 OR8U1Q8NH10 309 aa9.63□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 SPIN2AQ99865 258 aa9.63□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa9.63□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 ARV1Q9H2C2 271 aa9.63□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 APC2O95996 2303 aa9.62□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 TMEM50AO95807 157 aa9.62□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 HEXAP06865 529 aa9.62□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 OMGP23515 440 aa9.62□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 CEACAM6P40199 344 aa9.62□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 ZNF83P51522 516 aa9.62□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 PJVKQ0ZLH3 352 aa9.62□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 SVBPQ8N300 66 aa9.62□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 C20orf24Q9BUV8 137 aa9.62□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 IGSF23A1L1A6 192 aa9.62□□□□□ -0.87
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HPS1-208ENST00000467246 EPHA1P21709 976 aa9.62□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 LMO1P25800 156 aa9.62□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 S100GP29377 79 aa9.62□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 ID3Q02535 119 aa9.62□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 HMGN3Q15651 99 aa9.62□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 ACP7Q6ZNF0 438 aa9.62□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 LRP11Q86VZ4 500 aa9.62□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa9.62□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 CLEC18CQ8NCF0 446 aa9.62□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 S100PBPQ96BU1 408 aa9.62□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 SH3BGRL3Q9H299 93 aa9.62□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 DUSP13Q9UII6 198 aa9.62□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 METRNQ9UJH8 293 aa9.62□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 CEP295Q9C0D2 2601 aa9.61□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 BSNQ9UPA5 3926 aa9.61□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 ACACAQ13085 2346 aa9.61□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa9.61□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 IGKV1-39P01597 117 aa9.61□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 IGKV1D-39P04432 117 aa9.61□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 SERPINE2P07093 398 aa9.61□□□□□ -0.87
HPS1-208ENST00000467246 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
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