RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 Q6ZT83 130 aa7.23□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 FAM214BQ7L5A3 538 aa7.23□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 MDP1Q86V88 176 aa7.23□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 LINC00518Q8N0U6 118 aa7.23□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 WDR31Q8NA23 367 aa7.23□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 OR5C1Q8NGR4 320 aa7.23□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 DYRK2Q92630 601 aa7.23□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 SARAFQ96BY9 339 aa7.23□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 P2RX4Q99571 388 aa7.23□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 SCRT1Q9BWW7 348 aa7.23□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 BCL2L14Q9BZR8 327 aa7.23□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 RPS10P5Q9NQ39 176 aa7.23□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 PLA2G3Q9NZ20 509 aa7.23□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa7.23□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa7.23□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 FAM96BQ9Y3D0 163 aa7.23□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 RNF115Q9Y4L5 304 aa7.23□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 TIMM9Q9Y5J7 89 aa7.23□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 DOCK10Q96BY6 2186 aa7.23□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 DCHS1Q96JQ0 3298 aa7.23□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 SPEGQ15772 3267 aa7.22□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 TRAV17A0A0B4J275 112 aa7.22□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa7.22□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa7.22□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 IGSF23A1L1A6 192 aa7.22□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 C7orf77A4D0Y5 90 aa7.22□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 OOEPA6NGQ2 149 aa7.22□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 AHRRA9YTQ3 701 aa7.22□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 K7ENP7 123 aa7.22□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 AQP7O14520 342 aa7.22□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 HSD17B6O14756 317 aa7.22□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 HS3ST1O14792 307 aa7.22□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 TXNL1O43396 289 aa7.22□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 SYNGR2O43760 224 aa7.22□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 SSSCA1O60232 199 aa7.22□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 NXPH2O95156 264 aa7.22□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 IFNA1P01562 189 aa7.22□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 MBP02144 154 aa7.22□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 CA6P23280 308 aa7.22□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 HIKESHIQ53FT3 197 aa7.22□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 ZNF506Q5JVG8 444 aa7.22□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 C9orf135Q5VTT2 229 aa7.22□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 OR2T2Q6IF00 324 aa7.22□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 SLC25A24Q6NUK1 477 aa7.22□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 TMEM88Q6PEY1 159 aa7.22□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 IGFL2Q6UWQ7 119 aa7.22□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 Q6ZPA2 131 aa7.22□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 FAM90A1Q86YD7 464 aa7.22□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 C1QL4Q86Z23 238 aa7.22□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa7.22□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 SCCPDHQ8NBX0 429 aa7.22□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 FAM213BQ8TBF2 198 aa7.22□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 CD300LFQ8TDQ1 290 aa7.22□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 MBD3L1Q8WWY6 194 aa7.22□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 LURAP1Q96LR2 239 aa7.22□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 CXXC4Q9H2H0 198 aa7.22□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 TMEM231Q9H6L2 316 aa7.22□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 HES4Q9HCC6 221 aa7.22□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 ZNF581Q9P0T4 197 aa7.22□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 MED12Q93074 2177 aa7.22□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 SPTBN4Q9H254 2564 aa7.21□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa7.21□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 ARGFXA6NJG6 315 aa7.21□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 M0R036 132 aa7.21□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 AGPAT2O15120 278 aa7.21□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 SMPD2O60906 423 aa7.21□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 OR2H2O95918 312 aa7.21□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 IFNA17P01571 189 aa7.21□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 CRYBA1P05813 215 aa7.21□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 S100A6P06703 90 aa7.21□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 IGKV1-13P0DP09 117 aa7.21□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 CCL2P13500 99 aa7.21□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 KITLGP21583 273 aa7.21□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 TNFSF10P50591 281 aa7.21□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 DYNLT3P51808 116 aa7.21□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 P2RY6Q15077 328 aa7.21□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 PDCD1Q15116 288 aa7.21□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 C3orf36Q3SXR2 165 aa7.21□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 ZNF66Q6ZN08 573 aa7.21□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 SLC35E3Q7Z769 313 aa7.21□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 CBLN2Q8IUK8 224 aa7.21□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 IQCF2Q8IXL9 164 aa7.21□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 ZNF645Q8N7E2 425 aa7.21□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 NAXEQ8NCW5 288 aa7.21□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 PPP1R35Q8TAP8 253 aa7.21□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa7.21□□□□□ -1.26
ACTB-208ENST00000464611 RXFP4Q8TDU9 374 aa7.21□□□□□ -1.26
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