RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463372.5

C9orf3-211, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 919 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-211ENST00000463372 CA2P00918 260 aa9.66□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 BCL2L15Q5TBC7 163 aa9.66□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 OR5B3Q8NH48 314 aa9.66□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 EBF4Q9BQW3 602 aa9.66□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 CHRDL1Q9BU40 450 aa9.66□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 NDUFAF4Q9P032 175 aa9.66□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 A0A1B0GTI1 187 aa9.65□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 DIRAS1O95057 198 aa9.65□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 APOL3O95236 402 aa9.65□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 OR3A3P47888 321 aa9.65□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF134P52741 427 aa9.65□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 SMIM11AP58511 58 aa9.65□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP9.65□□□□□ -0.863e-7■■■■□ 26.1
C9orf3-211ENST00000463372 PDZK1IP1Q13113 114 aa9.65□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 CT45A1Q5HYN5 189 aa9.65□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 BTNL8Q6UX41 500 aa9.65□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 ANKRD42Q8N9B4 389 aa9.65□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 UXS1Q8NBZ7 420 aa9.65□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 CT45A3Q8NHU0 189 aa9.65□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa9.65□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 TMEM163Q8TC26 289 aa9.65□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 CHST5Q9GZS9 411 aa9.65□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 OR51V1Q9H2C8 321 aa9.65□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 MOB1AQ9H8S9 216 aa9.65□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 RHOFQ9HBH0 211 aa9.65□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 COA4Q9NYJ1 87 aa9.65□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 GNG12Q9UBI6 72 aa9.65□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 BAIAP2Q9UQB8 552 aa9.65□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF254O75437 659 aa9.64□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 KDM4BO94953 1096 aa9.64□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 GADD45GO95257 159 aa9.64□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 ALOX5APP20292 161 aa9.64□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 RIDAP52758 137 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 PAX5Q02548 391 aa9.64□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 TMEM187Q14656 261 aa9.64□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 FXYD3Q14802 87 aa9.64□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 CDK5R1Q15078 307 aa9.64□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 ASCL4Q6XD76 172 aa9.64□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 ELMOD2Q8IZ81 293 aa9.64□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 Q8NAQ8 132 aa9.64□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF439Q8NDP4 499 aa9.64□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 CD300LFQ8TDQ1 290 aa9.64□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 TSSK6Q9BXA6 273 aa9.64□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 IL20Q9NYY1 176 aa9.64□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa9.63□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 C15orf65H3BRN8 121 aa9.63□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 SLC22A1O15245 554 aa9.63□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 TUSC2O75896 110 aa9.63□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 IGKV1D-12P01611 117 aa9.63□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 KCNJ3P48549 501 aa9.63□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 Q6ZSR3 168 aa9.63□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 OR8D4Q8NGM9 314 aa9.63□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 KCNG3Q8TAE7 436 aa9.63□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 GHSRQ92847 366 aa9.63□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 TRAV24A0A0B4J272 114 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 GSTA4O15217 222 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 T-ENOLP0DO92 83 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 HCCSP53701 268 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 ODF3L2Q3SX64 289 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 STEAP3Q658P3 488 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF679Q8IYX0 411 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 OR2T33Q8NG76 320 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 OR10V1Q8NGI7 309 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 RFT1Q96AA3 541 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 TMEM68Q96MH6 324 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 NICN1Q9BSH3 213 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 SCRT1Q9BWW7 348 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 NEK6Q9HC98 313 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 OR52A1Q9UKL2 312 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 IKZF2Q9UKS7 526 aa9.62□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa9.61□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF320A2RRD8 509 aa9.61□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 TMEM213A2RRL7 107 aa9.61□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 PPP5D1E7EU14 171 aa9.61□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 FXYD1O00168 92 aa9.61□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 ORC5O43913 435 aa9.61□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 GGCTO75223 188 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 S1PR2O95136 353 aa9.61□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 OR2C1O95371 312 aa9.61□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 CA1P00915 261 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 ATP5G2Q06055 141 aa9.61□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 FAM131AQ6UXB0 335 aa9.61□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 CNIH3Q8TBE1 160 aa9.61□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 CMC2Q9NRP2 79 aa9.61□□□□□ -0.87
C9orf3-211ENST00000463372 SYT7O43581 403 aa9.6□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms