RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461653.5

RABGGTB-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 1,702 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-204ENST00000461653 PRR4Q16378 134 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 HIST3H3Q16695 136 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 ACSBG2Q5FVE4 666 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 TMEM144Q7Z5S9 345 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 COX18Q8N8Q8 333 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 DYDC1Q8WWB3 177 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC45A3Q96JT2 553 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 Q9H3A6 140 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 TXNIPQ9H3M7 391 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 HEBP1Q9NRV9 189 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 NYAP2Q9P242 653 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 PRO0628Q9UI54 55 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 DKKL1Q9UK85 242 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 NDUFAF1Q9Y375 327 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 DOCK2Q92608 1830 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 PTPN13Q12923 2485 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 ASPMQ8IZT6 3477 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 LOC730098B7Z3J9 87 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 I3L4J1 428 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 LAD1O00515 517 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 TNFSF13O75888 250 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 IGHV3-43DP0DP04 118 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 ICAM2P13598 275 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 PRSS3P35030 304 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 OR3A4PP47883 348 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 CDK9P50750 372 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 MNAT1P51948 309 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 TAS2R41P59536 307 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC35A2P78381 396 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 CXCL6P80162 114 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 DEFB103AP81534 67 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 MS4A2Q01362 244 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 ARFRP1Q13795 201 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 LY6DQ14210 128 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 HERPUD1Q15011 391 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 GUCA2BQ16661 112 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 TMEM215Q68D42 235 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF774Q6NX45 483 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 SFXN4Q6P4A7 337 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 CLEC19AQ6UXS0 136 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF493Q6ZR52 646 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 NAA40Q86UY6 237 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 TMEM105Q8N8V8 129 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 LRRC58Q96CX6 371 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 PTGES2Q9H7Z7 377 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 HHLA2Q9UM44 414 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-204ENST00000461653 A0A087WUJ7 227 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-204ENST00000461653 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC31A2O15432 143 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-204ENST00000461653 PLIN3O60664 434 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-204ENST00000461653 KBTBD11O94819 623 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-204ENST00000461653 HAND1O96004 215 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-204ENST00000461653 DHFRP00374 187 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-204ENST00000461653 CHTF8P0CG12 524 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-204ENST00000461653 MYL12AP19105 171 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-204ENST00000461653 CXCL2P19875 107 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-204ENST00000461653 RAB3AP20336 220 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-204ENST00000461653 PSMB2P49721 201 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-204ENST00000461653 NAA20P61599 178 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-204ENST00000461653 EDDM3AQ14507 147 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-204ENST00000461653 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-204ENST00000461653 C6orf99Q4VX62 202 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-204ENST00000461653 LIN52Q52LA3 116 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-204ENST00000461653 TMEM97Q5BJF2 176 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-204ENST00000461653 LRRC10Q5BKY1 277 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-204ENST00000461653 C2orf66Q6UXQ4 117 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-204ENST00000461653 FBXW12Q6X9E4 464 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-204ENST00000461653 OR2Z1Q8NG97 314 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-204ENST00000461653 OR1S1Q8NH92 325 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-204ENST00000461653 MFSD8Q8NHS3 518 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-204ENST00000461653 YIPF5Q969M3 257 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-204ENST00000461653 GALNT14Q96FL9 552 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-204ENST00000461653 CEP170P1Q96L14 293 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-204ENST00000461653 OR2V2Q96R30 315 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-204ENST00000461653 OR52B2Q96RD2 323 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-204ENST00000461653 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-204ENST00000461653 OR11A1Q9GZK7 315 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC25A31Q9H0C2 315 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-204ENST00000461653 SPNS1Q9H2V7 528 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC25A22Q9H936 323 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-204ENST00000461653 CTSZQ9UBR2 303 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-204ENST00000461653 PCYOX1Q9UHG3 505 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-204ENST00000461653 POLR1DQ9Y2S0 133 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-204ENST00000461653 ASTN1O14525 1302 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-204ENST00000461653 VWA8A3KMH1 1905 aa3.46□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms