RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445961.5

RPS9-208, Transcript of ribosomal protein S9, human

TSL 5

Gene RPS9, Length 944 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS9-208	ENST00000445961	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	UFD1	Q92890	307 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	YIPF6	Q96EC8	236 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	ETAA1	Q9NY74	926 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	UBE2QL1	A1L167	161 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	SERPINE3	A8MV23	424 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	C12orf77	C9JDV5	145 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	SLC22A1	O15245	554 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	ORC5	O43913	435 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	GABARAP	O95166	117 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	MAP2K4	P45985	399 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	INSL4	Q14641	139 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	RAB12	Q6IQ22	244 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	PRR18	Q8N4B5	295 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	TMEM104	Q8NE00	496 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	OR1L1	Q8NH94	360 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	FGF16	O43320	207 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	MGMT	P16455	207 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	CD36	P16671	472 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	ZNF134	P52741	427 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	LYPD6	Q86Y78	171 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	LINC00311	Q8N616	119 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	TMEM127	O75204	238 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	MPIG6B	O95866	241 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	IGHG2	P01859	326 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	HBZ	P02008	142 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	EBI3	Q14213	229 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961		Q8N9W7	124 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	FAM46B	Q96A09	425 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	GNG12	Q9UBI6	72 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	SPINT2	O43291	252 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	HSMCR30	P0CW71	290 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	IL3RA	P26951	378 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	C6orf183	Q5T699	404 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	OR10K2	Q6IF99	312 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	CDH26	Q8IXH8	852 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	STPG2	Q8N412	459 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961		Q8N6K4	173 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	ISOC1	Q96CN7	298 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961		Q96M66	194 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	DUX3	Q96PT4	197 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	STUB1	Q9UNE7	303 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	NUDT19	A8MXV4	375 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	FUT3	P21217	361 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	CD1B	P29016	333 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	F2RL1	P55085	397 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	KRTAP10-11	P60412	298 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	GNMT	Q14749	295 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	CTF1	Q16619	201 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	GPR107	Q5VW38	600 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS9-208	ENST00000445961	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62

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