RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 XKRY2A2RUG3 117 aa12.75□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 FOLR3P41439 243 aa12.75□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa12.75□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 CPT1CQ8TCG5 803 aa12.75□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa12.75□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 NEU1Q99519 415 aa12.75□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 SMIM7Q9BQ49 75 aa12.75□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
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TOP3B-206ENST00000436282 GPR179Q6PRD1 2367 aa12.74□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa12.74□□□□□ -0.37
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TOP3B-206ENST00000436282 A0A1W2PPB8 328 aa12.74□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 A0A1W2PRS3 328 aa12.74□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 KIR3DP1A8MWS1 328 aa12.74□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
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TOP3B-206ENST00000436282 WNT5BQ9H1J7 359 aa12.74□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 ATP23Q9Y6H3 246 aa12.74□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa12.74□□□□□ -0.37
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TOP3B-206ENST00000436282 TMEM241Q24JQ0 296 aa12.74□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa12.74□□□□□ -0.37
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TOP3B-206ENST00000436282 ACY3Q96HD9 319 aa12.74□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 DDA1Q9BW61 102 aa12.74□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa12.74□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 PRSS50Q9UI38 385 aa12.74□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 TCAPO15273 167 aa12.73□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 PDLIM4P50479 330 aa12.73□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 FGF12P61328 243 aa12.73□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 TCEAL6Q6IPX3 200 aa12.73□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 PPP5D1E7EU14 171 aa12.73□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF737O75373 536 aa12.73□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 IL18BPO95998 194 aa12.73□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 SERPINE2P07093 398 aa12.73□□□□□ -0.37
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TOP3B-206ENST00000436282 MLF1P58340 268 aa12.73□□□□□ -0.37
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TOP3B-206ENST00000436282 ARL16Q0P5N6 197 aa12.73□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 SLC10A1Q14973 349 aa12.73□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 OR51G1Q8NGK1 321 aa12.73□□□□□ -0.37
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TOP3B-206ENST00000436282 SYNGR2O43760 224 aa12.72□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 TRAPPC6AO75865 159 aa12.72□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 KBTBD11O94819 623 aa12.72□□□□□ -0.37
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TOP3B-206ENST00000436282 NTF4P34130 210 aa12.72□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 P2RY6Q15077 328 aa12.72□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 BSXQ3C1V8 233 aa12.72□□□□□ -0.37
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TOP3B-206ENST00000436282 NECAP1Q8NC96 275 aa12.72□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 NEK7Q8TDX7 302 aa12.72□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM170AQ8WVE7 144 aa12.72□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 SPSB4Q96A44 273 aa12.72□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 OR5B12Q96R08 314 aa12.72□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 PLK3Q9H4B4 646 aa12.72□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 PSENENQ9NZ42 101 aa12.72□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 NCOR1O75376 2440 aa12.72□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 KNTC1P50748 2209 aa12.72□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 H7BYZ3 331 aa12.72□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 CER1O95813 267 aa12.72□□□□□ -0.37
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TOP3B-206ENST00000436282 HBG2P69892 147 aa12.72□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 FOXB1Q99853 325 aa12.72□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 DNPH1O43598 174 aa12.71□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 CYTIPO60759 359 aa12.71□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 CBR3O75828 277 aa12.71□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 CYC1P08574 325 aa12.71□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 IAPPP10997 89 aa12.71□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 HOXA6P31267 233 aa12.71□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 PCBD1P61457 104 aa12.71□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 ERVS71-1P61550 626 aa12.71□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa12.71□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 PCSK4Q6UW60 755 aa12.71□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 Q6ZRM9 215 aa12.71□□□□□ -0.37
TOP3B-206ENST00000436282 HAPLN4Q86UW8 402 aa12.71□□□□□ -0.37
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