RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429581.2

PTPRD-AS2-201, Transcript of PTPRD antisense RNA 2 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD-AS2, Length 2,838 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TLNRD1Q9H1K6 362 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TREM2Q9NZC2 230 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DEFB108AA8MXU0 73 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 J3QW42 95 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CHST1O43916 411 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RND3P61587 244 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 EDDM3AQ14507 147 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF718Q3SXZ3 478 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 Q8IYB0 196 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TMEM171Q8WVE6 324 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C17orf50Q8WW18 174 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C9JQL5 133 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 WRBO00258 174 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IGKV1-39P01597 117 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IGKV1D-39P04432 117 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 VDAC1P21796 283 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 BMP5P22003 454 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CD80P33681 288 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SSTR5P35346 364 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 P2RY1P47900 373 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GLIPR1P48060 266 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SULT1A2P50226 295 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PJVKQ0ZLH3 352 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SWI5Q1ZZU3 235 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GPR146Q96CH1 333 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SMIM8Q96KF7 97 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CABLES2Q9BTV7 478 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MMP26Q9NRE1 261 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SLC25A15Q9Y619 301 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ATRXP46100 2492 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C12orf77C9JDV5 145 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 H0Y980 276 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PRH1P02810 166 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 VAMP2P63027 116 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SRPXP78539 464 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FAM27E3Q08E93 113 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RTP5Q14D33 572 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FAM201AQ5SY85 155 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IGF2-ASQ6U949 168 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 Q6ZS92 163 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 UBAC2Q8NBM4 344 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CXXC4Q9H2H0 198 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TPRP12270 2363 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.71
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RAB19A4D1S5 217 aa10.65□□□□□ -0.71
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.71
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.71
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.71
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ATG12O94817 140 aa10.65□□□□□ -0.71
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IGLV1-44P01699 117 aa10.65□□□□□ -0.71
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.71
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 EGR1P18146 543 aa10.65□□□□□ -0.71
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 COL10A1Q03692 680 aa10.65□□□□□ -0.71
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 AKIRIN2Q53H80 203 aa10.65□□□□□ -0.71
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 BTNL3Q6UXE8 466 aa10.65□□□□□ -0.71
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ACP7Q6ZNF0 438 aa10.65□□□□□ -0.71
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ASCL5Q7RTU5 278 aa10.65□□□□□ -0.71
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ODF3L1Q8IXM7 274 aa10.65□□□□□ -0.71
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TMEM252Q8N6L7 170 aa10.65□□□□□ -0.71
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OR5C1Q8NGR4 320 aa10.65□□□□□ -0.71
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.71
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LRRC29Q8WV35 223 aa10.65□□□□□ -0.71
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 COQ2Q96H96 371 aa10.65□□□□□ -0.71
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IFT22Q9H7X7 185 aa10.65□□□□□ -0.71
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IAPPP10997 89 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RUNX1Q01196 453 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DRAM1Q8N682 238 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OR5D13Q8NGL4 314 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 UQCC1Q9NVA1 299 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CACNG5Q9UF02 275 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TMEM210A6NLX4 147 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SPRY3O43610 288 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IL2RGP31785 369 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MDH2P40926 338 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF273Q14593 569 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MIDNQ504T8 468 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 BEND4Q6ZU67 534 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SPIN2AQ99865 258 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OR2D2Q9H210 308 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RAMP3O60896 148 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HEXAP06865 529 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DYNLT3P51808 116 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HNF4GQ14541 408 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 P2RY6Q15077 328 aa10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms