RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427110.6

PTPRC-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 264 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-208ENST00000427110 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP1.3□□□□□ -2.22e-7■■■□□ 15.8
PTPRC-208ENST00000427110 CXCR1P25024 350 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 RPL5P46777 297 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 IDH2P48735 452 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 TUFMP49411 452 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 TTPAP49638 278 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 PSMB2P49721 201 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 NUDT2P50583 147 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 STC1P52823 247 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 AQP4P55087 323 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 MTPNP58546 118 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 C1QTNF8P60827 252 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 MAXP61244 160 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 PSME3P61289 254 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 GRB2P62993 217 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
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PTPRC-208ENST00000427110 EMX2Q04743 252 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 BNIP2Q12982 314 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
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PTPRC-208ENST00000427110 POU6F1Q14863 301 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP1.3□□□□□ -2.2
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PTPRC-208ENST00000427110 CDKL4Q5MAI5 379 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 LPCAT4Q643R3 524 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 KDM4DQ6B0I6 523 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 ZNF470Q6ECI4 717 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 OR2W3Q7Z3T1 314 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 ARPINQ7Z6K5 226 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 SGPP2Q8IWX5 399 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 CCNYL1Q8N7R7 359 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 LINC00469Q8N7U9 141 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 SLC35G3Q8N808 338 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 ZNF680Q8NEM1 530 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 OR13C4Q8NGS5 318 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 STAG3L4Q8TBR4 150 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 PYDC1Q8WXC3 89 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 BAALCQ8WXS3 180 aa1.3□□□□□ -2.2
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PTPRC-208ENST00000427110 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 S100PBPQ96BU1 408 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 DCUN1D1Q96GG9 259 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 FAM19A4Q96LR4 140 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 GLT1D1Q96MS3 346 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 BIRC8Q96P09 236 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 CATSPER2Q96P56 530 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 LYSMD1Q96S90 227 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 TSC22D3Q99576 134 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 SEC22CQ9BRL7 303 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
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PTPRC-208ENST00000427110 Q9H521 79 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 POMKQ9H5K3 350 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 RDH14Q9HBH5 336 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 VCX3AQ9NNX9 186 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 GID8Q9NWU2 228 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 TAS2R13Q9NYV9 303 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 UBAP1Q9NZ09 502 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 RAB22AQ9UL26 194 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 FLVCR2Q9UPI3 526 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 AP3M1Q9Y2T2 418 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 PPIL1Q9Y3C6 166 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 AP4S1Q9Y587 144 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 OR51B4Q9Y5P0 310 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 SNX10Q9Y5X0 201 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 GMEB1Q9Y692 573 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 C2orf16Q68DN1 1984 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 CEP350Q5VT06 3117 aa1.3□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
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PTPRC-208ENST00000427110 OR6C70A6NIJ9 312 aa1.29□□□□□ -2.2
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PTPRC-208ENST00000427110 UPK1AO00322 258 aa1.29□□□□□ -2.2
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PTPRC-208ENST00000427110 ETHE1O95571 254 aa1.29□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 OTCP00480 354 aa1.29□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 LHBP01229 141 aa1.29□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 TRBC1P01850 177 aa1.29□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 IGLV7-43P04211 117 aa1.29□□□□□ -2.2
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PTPRC-208ENST00000427110 MPC1LP0DKB6 136 aa1.29□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP1.29□□□□□ -2.2
PTPRC-208ENST00000427110 SRMP19623 302 aa1.29□□□□□ -2.2
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