RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412845.1

NEFHP1-201, Transcript of neurofilament heavy pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene NEFHP1, Length 2,629 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP1-201ENST00000412845 OR1A1Q9P1Q5 309 aa15.99■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 GAB2Q9UQC2 676 aa15.99■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 A0A096LPE4 126 aa15.99■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 A0A1W2PPZ6 126 aa15.99■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa15.99■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 TGOLN2O43493 480 aa15.99■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 CTXN2P0C2S0 81 aa15.99■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 GZMBP10144 247 aa15.99■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 CD81P60033 236 aa15.99■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 C16orf82Q7Z2V1 217 aa15.99■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 TMEM183AQ8IXX5 376 aa15.99■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 IL1F10Q8WWZ1 152 aa15.99■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 CLDN23Q96B33 292 aa15.99■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 POM121Q96HA1 1249 aa15.99■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa15.99■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 ARGFXA6NJG6 315 aa15.98■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 TRAPPC2LH3BP13 241 aa15.98■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 IGKV1-5P01602 117 aa15.98■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 SRD5A2P31213 254 aa15.98■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 CLEC12BQ2HXU8 276 aa15.98■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa15.98■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa15.98■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 OR5R1Q8NH85 324 aa15.98■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 OR10J5Q8NHC4 309 aa15.98■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 ADGRG7Q96K78 797 aa15.98■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 PRDM6Q9NQX0 595 aa15.98■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 IGKV1D-33P01593 117 aa15.98■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 IGKV1-33P01594 117 aa15.98■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 PFN1P07737 140 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 GZMHP20718 246 aa15.98■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 TUBG1P23258 451 aa15.98■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 MRGPRGQ86SM5 289 aa15.98■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 OR4C12Q96R67 309 aa15.98■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 P2RX4Q99571 388 aa15.98■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 SMIM7Q9BQ49 75 aa15.98■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 MED12LQ86YW9 2145 aa15.98■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 SLC31A2O15432 143 aa15.98■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 ZNF737O75373 536 aa15.98■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 TRAPPC6AO75865 159 aa15.98■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 IGLV2-14P01704 120 aa15.98■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 PAX1P15863 534 aa15.98■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 ERVS71-1P61550 626 aa15.98■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 IGFBP7Q16270 282 aa15.98■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 CEACAM21Q3KPI0 293 aa15.98■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa15.98■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 LILRB2Q8N423 598 aa15.98■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 AGBL5Q8NDL9 886 aa15.98■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 PRRG4Q9BZD6 226 aa15.98■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 FRYQ5TBA9 3013 aa15.97■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 TRAV24A0A0B4J272 114 aa15.97■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 C5orf49A4QMS7 147 aa15.97■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 IFNA10P01566 189 aa15.97■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 SLC25A6P12236 298 aa15.97■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 P2RY6Q15077 328 aa15.97■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 MKXQ8IYA7 352 aa15.97■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 SAXO1Q8IYX7 474 aa15.97■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 UBALD1Q8TB05 177 aa15.97■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 MISP3Q96FF7 219 aa15.97■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 CTDSP1Q9GZU7 261 aa15.97■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 SRD5A3Q9H8P0 318 aa15.97■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa15.97■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 LAMP3Q9UQV4 416 aa15.97■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa15.97■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 CD300LBA8K4G0 201 aa15.97■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 COL19A1Q14993 1142 aa15.97■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 TMEM41BQ5BJD5 291 aa15.97■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 SPANXN5Q5MJ07 72 aa15.97■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 NCR3LG1Q68D85 454 aa15.97■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 ELOVL1Q9BW60 279 aa15.97■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 NGFP01138 241 aa15.96■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 S100GP29377 79 aa15.96■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 RTP5Q14D33 572 aa15.96■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 DBX2Q6ZNG2 339 aa15.96■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 ZNF664Q8N3J9 261 aa15.96■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 OR1P1Q8NH06 330 aa15.96■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 KCNE4Q8WWG9 221 aa15.96■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
NEFHP1-201ENST00000412845 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa15.96■□□□□ 0.14
NEFHP1-201ENST00000412845 LILRA1O75019 489 aa15.96■□□□□ 0.14
NEFHP1-201ENST00000412845 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
NEFHP1-201ENST00000412845 FGF5P12034 268 aa15.96■□□□□ 0.14
NEFHP1-201ENST00000412845 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
NEFHP1-201ENST00000412845 ARF1P84077 181 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
NEFHP1-201ENST00000412845 SERF2P84101 59 aa15.96■□□□□ 0.14
NEFHP1-201ENST00000412845 HLA-BQ31612 363 aa15.96■□□□□ 0.14
NEFHP1-201ENST00000412845 PRR18Q8N4B5 295 aa15.96■□□□□ 0.14
NEFHP1-201ENST00000412845 PSMF1Q92530 271 aa15.96■□□□□ 0.14
NEFHP1-201ENST00000412845 LHX4Q969G2 390 aa15.96■□□□□ 0.14
NEFHP1-201ENST00000412845 NAT8Q9UHE5 227 aa15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms