RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 EGR1P18146 543 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 GFI1BQ5VTD9 330 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 SOSTQ9BQB4 213 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 SMIM17P0DL12 118 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 WNT5AP41221 380 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 CRYBA2P53672 197 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 LGALS4P56470 323 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 PPP1CAP62136 330 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 PARM1Q6UWI2 310 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 ARL17AQ8IVW1 177 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 A0A1W2PPV9 198 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 LAMTOR5O43504 91 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 NPIPB7O75200 414 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 CD40P25942 277 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 CD1BP29016 333 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 MAJINQ3KP22 176 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 AP5S1Q9NUS5 200 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 ARAP2Q8WZ64 1704 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 PTPRFP10586 1907 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 OR4X1Q8NH49 305 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 UFC1Q9Y3C8 167 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 AUP1Q9Y679 476 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 HBZP02008 142 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 LYZP61626 148 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 P2RY6Q15077 328 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 TEPPQ6URK8 271 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 IMMP2LQ96T52 175 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 DTX4Q9Y2E6 619 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 SCN3AQ9NY46 2000 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 LIPT2A6NK58 231 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 ZNF785A8K8V0 405 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 CD27P26842 260 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP8.53□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 VMA21Q3ZAQ7 101 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 DNLZQ5SXM8 178 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 FAM60AQ9NP50 221 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 IL36GQ9NZH8 169 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 CLDN16Q9Y5I7 305 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 PXMP4Q9Y6I8 212 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 USP54Q70EL1 1684 aa8.52□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 NUDT3O95989 172 aa8.52□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 AMY1AP04745 511 aa8.52□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 SAMD13Q5VXD3 122 aa8.52□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 IL36RNQ9UBH0 155 aa8.52□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 SSC5DA1L4H1 1573 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 A0A087WWC5 75 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 IGKV1D-16P01601 117 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 C10orf35Q96D05 121 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 MRGPRX1Q96LB2 322 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 HIST1H2BLQ99880 126 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 RIPPLY3P57055 190 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 LSM6P62312 80 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 PQLC2Q6ZP29 291 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 MMD2Q8IY49 270 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 TMEM52Q8NDY8 209 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 OR8B2Q96RD0 313 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 OR2T8A6NH00 312 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 HLA-DRB1P01911 266 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 SLC23A3Q6PIS1 610 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 OR4S2Q8NH73 311 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 SFRP2Q96HF1 295 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 COX14Q96I36 57 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 RPRMQ9NS64 109 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 TMEM265A0A087WTH1 108 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 IL2RAP01589 272 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 ASAH2BP0C7U1 165 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 LY6G6FQ5SQ64 297 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 MTURNQ8N3F0 131 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 BOD1Q96IK1 185 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-202ENST00000402738 MFRPQ9BY79 579 aa8.51□□□□□ -1.05
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