RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 KCNIP1Q9NZI2 227 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 GNG12Q9UBI6 72 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 COL6A5A8TX70 2615 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 RGS5O15539 181 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 SCGNO76038 276 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 MELTFP08582 738 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 GSTT2P0CG29 244 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 GSTT2BP0CG30 244 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 LGALS4P56470 323 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 HLA-DRB3P79483 266 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 HLA-DRB5Q30154 266 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 MORN2Q502X0 79 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 FBLN7Q53RD9 439 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 CT45A1Q5HYN5 189 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM69Q5SWH9 247 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF439Q8NDP4 499 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 OR52M1Q8NGK5 317 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 CT45A3Q8NHU0 189 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 AP3S1Q92572 193 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 GALMQ96C23 342 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 PRDM13Q9H4Q3 707 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 FAM96BQ9Y3D0 163 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 A0A0A6YYH2 397 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 A6NJ64 397 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 FAM25AB3EWG3 89 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 FAM25CB3EWG5 89 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 FAM25GB3EWG6 89 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 TRDCB7Z8K6 153 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 FBP1P09467 338 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 GNG2P59768 71 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 HILS1P60008 231 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 MZT2AQ6P582 158 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 TRAT1Q6PIZ9 186 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 Q6YL49 198 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 MOB1BQ7L9L4 216 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF554Q86TJ5 538 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 SNX29P2Q8IUI4 249 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 BEND2Q8NDZ0 799 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 OR10A7Q8NGE5 316 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 OR9G1Q8NH87 305 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 ZDHHC16Q969W1 377 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 MMP28Q9H239 520 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 SLC23A1Q9UHI7 598 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 LY6LH3BQJ8 138 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 TOR1AO14656 332 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 BET1O15155 118 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 FABP7O15540 132 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 TCF21O43680 179 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 CD24P25063 80 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 HTR1DP28221 377 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 TALDO1P37837 337 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 HTD2P86397 168 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 BAMBIQ13145 260 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 SLC9A3R2Q15599 337 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 CNIH2Q6PI25 160 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF596Q8TC21 504 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 PIFOQ8TCI5 191 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 DPM3Q9P2X0 92 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 EXTL2Q9UBQ6 330 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-201ENST00000309641 TENM1Q9UKZ4 2725 aa7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 IFNA2P01563 188 aa7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 DTYMKP23919 212 aa7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 CEACAM6P40199 344 aa7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 MNDAP41218 407 aa7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 IER3P46695 156 aa7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 REG1BP48304 166 aa7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 PRRX1P54821 245 aa7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 SCGB2A2Q13296 93 aa7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 ARL6IP1Q15041 203 aa7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 MCFD2Q8NI22 146 aa7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 SNAPC3Q92966 411 aa7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 MALSU1Q96EH3 234 aa7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 CMTM3Q96MX0 182 aa7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 ABHD1Q96SE0 405 aa7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 SSX3Q99909 188 aa7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 CHIAQ9BZP6 476 aa7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 MEGF9Q9H1U4 602 aa7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 JPT1Q9UK76 154 aa7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 H3BUX3 64 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 ST8SIA5O15466 376 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 YPEL1O60688 119 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 RIPPLY3P57055 190 aa7.33□□□□□ -1.24
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