RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295628.3

LRRC58-201, Transcript of leucine rich repeat containing 58, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRC58, Length 7,903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC58-201ENST00000295628 NT5CQ8TCD5 201 aa14.73□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 CA10Q9NS85 328 aa14.73□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa14.73□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 PTOV1Q86YD1 416 aa14.73□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 OR10AC1Q8NH08 325 aa14.73□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 GPR82Q96P67 336 aa14.73□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 CCL28Q9NRJ3 127 aa14.73□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa14.73□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa14.72□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 SSTR5P35346 364 aa14.72□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 HYAL1Q12794 435 aa14.72□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 TEX30Q5JUR7 227 aa14.72□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 TRAV21A0A0B4J279 112 aa14.72□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 CEACAM18A8MTB9 384 aa14.72□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 CX3CL1P78423 397 aa14.72□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 LRRC61Q9BV99 259 aa14.72□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 CXCL16Q9H2A7 254 aa14.72□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 CXorf65A6NEN9 183 aa14.72□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 DEFB124Q8NES8 71 aa14.72□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 ID4P47928 161 aa14.72□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 CCR5P51681 352 aa14.72□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 OPN4Q9UHM6 478 aa14.72□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 SIGLEC7Q9Y286 467 aa14.72□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 SYNGR1O43759 233 aa14.72□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 LYZL2Q7Z4W2 148 aa14.72□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 OVCH2Q7RTZ1 564 aa14.72□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 OR4D5Q8NGN0 318 aa14.72□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 A8MWL6 223 aa14.71□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 EML2O95834 649 aa14.71□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa14.71□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 ANKRD37Q7Z713 158 aa14.71□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 OR5A1Q8NGJ0 315 aa14.71□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 DUX5Q96PT3 197 aa14.71□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 A0A1B0GV90 55 aa14.71□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 WNT9BO14905 357 aa14.71□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 OR2A4O95047 310 aa14.71□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 PF4V1P10720 104 aa14.71□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 MS4A4AQ96JQ5 239 aa14.71□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 OR2A7Q96R45 310 aa14.71□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 PARLQ9H300 379 aa14.71□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 PLPPR5Q32ZL2 321 aa14.71□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 DNASE2BQ8WZ79 361 aa14.71□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa14.71□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 SPEM2Q0P670 501 aa14.71□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 ASB10Q8WXI3 467 aa14.71□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 SLC25A42Q86VD7 318 aa14.71□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 UQCR10Q9UDW1 63 aa14.71□□□□□ -0.05
LRRC58-201ENST00000295628 AMY1AP04745 511 aa14.71□□□□□ -0.06
LRRC58-201ENST00000295628 ANOS1P23352 680 aa14.71□□□□□ -0.06
LRRC58-201ENST00000295628 C10orf128Q5T292 105 aa14.71□□□□□ -0.06
LRRC58-201ENST00000295628 HYPMO75409 117 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC58-201ENST00000295628 RNF122Q9H9V4 155 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC58-201ENST00000295628 FER1L5A0AVI2 2057 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC58-201ENST00000295628 NDUFB4O95168 129 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC58-201ENST00000295628 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
LRRC58-201ENST00000295628 SSPNQ14714 243 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC58-201ENST00000295628 OR2V2Q96R30 315 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC58-201ENST00000295628 SYT11Q9BT88 431 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC58-201ENST00000295628 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC58-201ENST00000295628 A0A0B4J2E0 115 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC58-201ENST00000295628 A0A1B0GX12 115 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC58-201ENST00000295628 CXCL3P19876 107 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC58-201ENST00000295628 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC58-201ENST00000295628 C5P01031 1676 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC58-201ENST00000295628 PPYP01298 95 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC58-201ENST00000295628 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
LRRC58-201ENST00000295628 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
LRRC58-201ENST00000295628 LTBP3Q9NS15 1303 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC58-201ENST00000295628 MVDP53602 400 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC58-201ENST00000295628 FXYD3Q14802 87 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC58-201ENST00000295628 MDP1Q86V88 176 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC58-201ENST00000295628 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
LRRC58-201ENST00000295628 PITX3O75364 302 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC58-201ENST00000295628 MOSPD3O75425 235 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC58-201ENST00000295628 PRDX2P32119 198 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC58-201ENST00000295628 COL10A1Q03692 680 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC58-201ENST00000295628 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
LRRC58-201ENST00000295628 RBKSQ9H477 322 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC58-201ENST00000295628 ZBTB42B2RXF5 422 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC58-201ENST00000295628 TRGC2P03986 189 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC58-201ENST00000295628 TMEM170BQ5T4T1 132 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC58-201ENST00000295628 FAM206AQ9NX38 181 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC58-201ENST00000295628 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa14.69□□□□□ -0.06
LRRC58-201ENST00000295628 C2orf88Q9BSF0 95 aa14.69□□□□□ -0.06
LRRC58-201ENST00000295628 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa14.69□□□□□ -0.06
LRRC58-201ENST00000295628 RAB9AP51151 201 aa14.69□□□□□ -0.06
LRRC58-201ENST00000295628 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa14.69□□□□□ -0.06
LRRC58-201ENST00000295628 FOLR2P14207 255 aa14.69□□□□□ -0.06
LRRC58-201ENST00000295628 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
LRRC58-201ENST00000295628 PXMP4Q9Y6I8 212 aa14.69□□□□□ -0.06
LRRC58-201ENST00000295628 SRFP11831 508 aa14.69□□□□□ -0.06
LRRC58-201ENST00000295628 VSTM2LQ96N03 204 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms