RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 ADCYAP1P18509 176 aa7.58□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 FFAR4Q5NUL3 377 aa7.58□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 ZNF645Q8N7E2 425 aa7.58□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 OR10G4Q8NGN3 311 aa7.58□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 WFDC1Q9HC57 220 aa7.58□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 NUP210LQ5VU65 1888 aa7.58□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa7.58□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa7.58□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 LRRC3CA6NJW4 275 aa7.58□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 DKK1O94907 266 aa7.58□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 IGKV1D-12P01611 117 aa7.58□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 ADH4P08319 380 aa7.58□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 ZNF66Q6ZN08 573 aa7.58□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 RTN4RL2Q86UN3 420 aa7.58□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 CALHM1Q8IU99 346 aa7.58□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 BMPERQ8N8U9 685 aa7.58□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 OR10G9Q8NGN4 311 aa7.58□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 OR10G7Q8NGN6 311 aa7.58□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 C1QL1O75973 258 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 CEACAM1P13688 526 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 OR3A1P47881 315 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 RAB7AP51149 207 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 ID3Q02535 119 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 GCNT2Q8N0V5 402 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 SH2D2AQ9NP31 389 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 A0A0G2JMM0 328 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 A0A1W2PPB8 328 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 A0A1W2PRS3 328 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 COLCA2A8K830 154 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 KIR3DP1A8MWS1 328 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 F6UZH7 168 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP7.57□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 S1PR3Q99500 378 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 U3KQA8 63 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 OR2H2O95918 312 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 KITLGP21583 273 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 THBS3P49746 956 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 ZADH2Q8N4Q0 377 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 TRAV17A0A0B4J275 112 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 C5orf63A6NC05 138 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 SRP19P09132 144 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 GLIPR1P48060 266 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 LHX2P50458 406 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 SLC16A13Q7RTY0 426 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 AP1S3Q96PC3 154 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 MPDZO75970 2070 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 E9PLN8 166 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 RAB29O14966 203 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 KRASP01116 189 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 CCL11P51671 97 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 CLDN18P56856 261 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 DTD1Q8TEA8 209 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 SDSLQ96GA7 329 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 RARRES2Q99969 163 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 OR51M1Q9H341 326 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 MTCH1Q9NZJ7 389 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 NKX6-3A6NJ46 265 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 GALR1P47211 349 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 HTD2P86397 168 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 BSXQ3C1V8 233 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 SCCPDHQ8NBX0 429 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 PRSS50Q9UI38 385 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 UBE2CO00762 179 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 NAPSAO96009 420 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 EDDM3AQ14507 147 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 SSX9Q7RTT3 188 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 C1QL4Q86Z23 238 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 SLC25A40Q8TBP6 338 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 TXNDC17Q9BRA2 123 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 SEC16AO15027 2179 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 CDIPTO14735 213 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 GZMHP20718 246 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 FHITP49789 147 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 GFRA1P56159 465 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 RUNX1Q01196 453 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 POM121L2Q96KW2 1035 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 ZNF488Q96MN9 340 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 HINT2Q9BX68 163 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 THADAQ6YHU6 1953 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 PDE6DO43924 150 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-201ENST00000264345 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
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