RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000252487.9

TOMM40-201, Transcript of translocase of outer mitochondrial membrane 40, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOMM40, Length 1,707 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40-201ENST00000252487 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
TOMM40-201ENST00000252487 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa21.41■■□□□ 1.02
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TOMM40-201ENST00000252487 FPR2P25090 351 aa21.41■■□□□ 1.02
TOMM40-201ENST00000252487 LOXL3P58215 753 aa21.41■■□□□ 1.02
TOMM40-201ENST00000252487 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
TOMM40-201ENST00000252487 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
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TOMM40-201ENST00000252487 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
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TOMM40-201ENST00000252487 SUCNR1Q9BXA5 334 aa21.4■■□□□ 1.02
TOMM40-201ENST00000252487 ZNF69Q9UC07 566 aa21.4■■□□□ 1.02
TOMM40-201ENST00000252487 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP21.39■■□□□ 1.022e-7■■■■■ 34.9
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TOMM40-201ENST00000252487 C17orf98A8MV24 154 aa21.39■■□□□ 1.01
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TOMM40-201ENST00000252487 GFOD1Q9NXC2 390 aa21.39■■□□□ 1.01
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TOMM40-201ENST00000252487 IGHV1-8P0DP01 117 aa21.38■■□□□ 1.01
TOMM40-201ENST00000252487 RGS21Q2M5E4 152 aa21.38■■□□□ 1.01
TOMM40-201ENST00000252487 OR6F1Q8NGZ6 308 aa21.38■■□□□ 1.01
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TOMM40-201ENST00000252487 OCEL1Q9H607 264 aa21.38■■□□□ 1.01
TOMM40-201ENST00000252487 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa21.38■■□□□ 1.01
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TOMM40-201ENST00000252487 IGKV1-13P0DP09 117 aa21.38■■□□□ 1.01
TOMM40-201ENST00000252487 SLC6A1P30531 599 aa21.38■■□□□ 1.01
TOMM40-201ENST00000252487 GNG10P50151 68 aa21.38■■□□□ 1.01
TOMM40-201ENST00000252487 AADACL3Q5VUY0 350 aa21.38■■□□□ 1.01
TOMM40-201ENST00000252487 DHRS11Q6UWP2 260 aa21.38■■□□□ 1.01
TOMM40-201ENST00000252487 FXYD6Q9H0Q3 95 aa21.38■■□□□ 1.01
TOMM40-201ENST00000252487 SIRT7Q9NRC8 400 aa21.38■■□□□ 1.01
TOMM40-201ENST00000252487 ZNRD1Q9P1U0 126 aa21.38■■□□□ 1.01
TOMM40-201ENST00000252487 A0A1W2PPH5 198 aa21.37■■□□□ 1.01
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TOMM40-201ENST00000252487 BAMBIQ13145 260 aa21.37■■□□□ 1.01
TOMM40-201ENST00000252487 C11orf91Q3C1V1 193 aa21.37■■□□□ 1.01
TOMM40-201ENST00000252487 TMEM17Q86X19 198 aa21.37■■□□□ 1.01
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TOMM40-201ENST00000252487 TOMM40LQ969M1 308 aa21.37■■□□□ 1.01
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TOMM40-201ENST00000252487 JPT1Q9UK76 154 aa21.37■■□□□ 1.01
TOMM40-201ENST00000252487 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
TOMM40-201ENST00000252487 SVEP1Q4LDE5 3571 aa21.37■■□□□ 1.01
TOMM40-201ENST00000252487 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
TOMM40-201ENST00000252487 SLC31A2O15432 143 aa21.36■■□□□ 1.01
TOMM40-201ENST00000252487 TUSC2O75896 110 aa21.36■■□□□ 1.01
TOMM40-201ENST00000252487 PPYP01298 95 aa21.36■■□□□ 1.01
TOMM40-201ENST00000252487 MORN2Q502X0 79 aa21.36■■□□□ 1.01
TOMM40-201ENST00000252487 PLA1AQ53H76 456 aa21.36■■□□□ 1.01
TOMM40-201ENST00000252487 LHFPL1Q86WI0 220 aa21.36■■□□□ 1.01
TOMM40-201ENST00000252487 GIMAP1Q8WWP7 306 aa21.36■■□□□ 1.01
TOMM40-201ENST00000252487 MMP28Q9H239 520 aa21.36■■□□□ 1.01
TOMM40-201ENST00000252487 SLC2A8Q9NY64 477 aa21.36■■□□□ 1.01
TOMM40-201ENST00000252487 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa21.36■■□□□ 1.01
TOMM40-201ENST00000252487 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
TOMM40-201ENST00000252487 TMEM249Q2WGJ8 235 aa21.35■■□□□ 1.01
TOMM40-201ENST00000252487 TERB2Q8NHR7 220 aa21.35■■□□□ 1.01
TOMM40-201ENST00000252487 MARCH1Q8TCQ1 289 aa21.35■■□□□ 1.01
TOMM40-201ENST00000252487 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
TOMM40-201ENST00000252487 C1orf159Q96HA4 380 aa21.35■■□□□ 1.01
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TOMM40-201ENST00000252487 SESN1Q9Y6P5 492 aa21.35■■□□□ 1.01
TOMM40-201ENST00000252487 OTOGQ6ZRI0 2925 aa21.35■■□□□ 1.01
TOMM40-201ENST00000252487 B4DSR2 109 aa21.35■■□□□ 1.01
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TOMM40-201ENST00000252487 IGHV4-31P0DP07 118 aa21.35■■□□□ 1.01
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TOMM40-201ENST00000252487 DPAGT1Q9H3H5 408 aa21.35■■□□□ 1.01
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TOMM40-201ENST00000252487 ST8SIA5O15466 376 aa21.34■■□□□ 1.01
TOMM40-201ENST00000252487 PTTG1O95997 202 aa21.34■■□□□ 1.01
TOMM40-201ENST00000252487 COX7A1P24310 79 aa21.34■■□□□ 1.01
TOMM40-201ENST00000252487 KLRD1Q13241 179 aa21.34■■□□□ 1.01
TOMM40-201ENST00000252487 BTNL3Q6UXE8 466 aa21.34■■□□□ 1.01
TOMM40-201ENST00000252487 MOB3AQ96BX8 217 aa21.34■■□□□ 1.01
TOMM40-201ENST00000252487 SIRPDQ9H106 197 aa21.34■■□□□ 1.01
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