RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 BOD1Q96IK1 185 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC25A31Q9H0C2 315 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A087WWC5 75 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 PITX3O75364 302 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 DIRAS3O95661 229 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 OR8U8P0C7N1 319 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 HERV-K104P61576 105 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM24BQ8N5W8 94 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 ISOC2Q96AB3 205 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 BORCS8Q96FH0 119 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 HIPK2Q9H2X6 1198 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 SIAH2O43255 324 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 HSPA12AO43301 675 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 HIKESHIQ53FT3 197 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM42Q69YG0 159 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 OSR2Q8N2R0 312 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 YPEL4Q96NS1 127 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 CRLF2Q9HC73 371 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1W2PPE3 182 aa22.33■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa22.33■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2C1O95371 312 aa22.33■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 MMP9P14780 707 aa22.33■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 CBR1P16152 277 aa22.33■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 ADAM5Q6NVV9 412 aa22.33■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 C20orf196Q8IYI0 205 aa22.33■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2C3Q8N628 320 aa22.33■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 REEP6Q96HR9 211 aa22.33■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 ULBP2Q9BZM5 246 aa22.33■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 C11orf1Q9H5F2 150 aa22.33■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1W2PR64 198 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1W2PRV1 198 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 XRCC2O43543 280 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 DMRTC1Q5HYR2 192 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC22A25Q6T423 547 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 HEPN1Q6WQI6 88 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 OR52M1Q8NGK5 317 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM213BQ8TBF2 198 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 FBXO7Q9Y3I1 522 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 CXorf65A6NEN9 183 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 CST2P09228 141 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP10-9P60411 292 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 MALLQ13021 153 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 GABRA6Q16445 453 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 SNAI3Q3KNW1 292 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 DPPA3Q6W0C5 159 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR137CQ8N3F9 429 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 SH3BGRL3Q9H299 93 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR35Q9HC97 309 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 KIAA1456Q9P272 454 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 RBFOX3A6NFN3 312 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 PDCD6O75340 191 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 FXYD4P59646 89 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 NHLH2Q02577 135 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 Q6ZS49 121 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 FBXL14Q8N1E6 418 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 OR10AD1Q8NGE0 317 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 OR5L1Q8NGL2 311 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 C20orf24Q9BUV8 137 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC00470Q9BZP3 86 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 MIOXQ9UGB7 285 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 FHITP49789 147 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 FUT6P51993 359 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 CEACAM16Q2WEN9 425 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 PHLDA2Q53GA4 152 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 WFDC8Q8IUA0 241 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM56Q96MV1 263 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC7A11Q9UPY5 501 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A096LPE4 126 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1W2PPZ6 126 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 TRDCB7Z8K6 153 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF587BE7ETH6 402 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 GATCO43716 136 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 SYNGR3O43761 229 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 CLN5O75503 358 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 NQO2P16083 231 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 RND3P61587 244 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 RPS23P62266 143 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 CLEC9AQ6UXN8 241 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 FBXO17Q96EF6 278 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM222Q9H0R3 208 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 SIRT7Q9NRC8 400 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-201ENST00000246533 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms