RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640511.1

SPIN3-241, Transcript of spindlin family member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SPIN3, Length 3,102 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3-241ENST00000640511 THYN1Q9P016 225 aa10.15□□□□□ -0.78
SPIN3-241ENST00000640511 WASHC3Q9Y3C0 194 aa10.15□□□□□ -0.78
SPIN3-241ENST00000640511 F2Z2F3 143 aa10.15□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 J3QR06 171 aa10.15□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 EOMESO95936 686 aa10.15□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 WNT2P09544 360 aa10.15□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 PSMB3P49720 205 aa10.15□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 ZIC1Q15915 447 aa10.15□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 PMCHL1Q16048 86 aa10.15□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 C22orf39Q6P5X5 142 aa10.15□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 SGMS2Q8NHU3 365 aa10.15□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 SPSB1Q96BD6 273 aa10.15□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 GAGE10A6NGK3 116 aa10.14□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 TTRP02766 147 aa10.14□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 ZNF154Q13106 437 aa10.14□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 HLA-BQ31612 363 aa10.14□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 SPACA5Q96QH8 159 aa10.14□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 GRXCR1A8MXD5 290 aa10.14□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 ZNF728P0DKX0 622 aa10.14□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 CCNOP22674 350 aa10.14□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 KIAA1644Q3SXP7 199 aa10.14□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 TMEM177Q53S58 311 aa10.14□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 STUMQ69YW2 141 aa10.14□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 SCGB1C1Q8TD33 95 aa10.14□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 PECRQ9BY49 303 aa10.14□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 VSIRQ9H7M9 311 aa10.14□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 TET1Q8NFU7 2136 aa10.14□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 A0A1W2PP11 408 aa10.13□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 ERGP11308 486 aa10.13□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 NTHL1P78549 312 aa10.13□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 TLE1Q04724 770 aa10.13□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 FMODQ06828 376 aa10.13□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 COLCA1Q6ZS62 124 aa10.13□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 OR2M3Q8NG83 312 aa10.13□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 LHX4Q969G2 390 aa10.13□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 C8orf44Q96CB5 159 aa10.13□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 OR10A2Q9H208 303 aa10.13□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 A0A1W2PPV9 198 aa10.13□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 M0R1X1 148 aa10.13□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 ZNF205O95201 554 aa10.13□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 C3orf79P0CE67 100 aa10.13□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 PHLDA2Q53GA4 152 aa10.13□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 SLC39A11Q8N1S5 342 aa10.13□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 OR51T1Q8NGJ9 327 aa10.13□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 OR4F5Q8NH21 305 aa10.13□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 OR52N5Q8NH56 324 aa10.13□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 CACNG8Q8WXS5 425 aa10.13□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 DERL1Q9BUN8 251 aa10.13□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 RARRES3Q9UL19 164 aa10.13□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa10.13□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 MUC21A0A140T8X8 626 aa10.13□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 SELPP16109 830 aa10.13□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 CBLN1P23435 193 aa10.13□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 CD70P32970 193 aa10.13□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 MUC21Q5SSG8 566 aa10.13□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 POLR1DQ9Y2S0 133 aa10.13□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 SELENOKQ9Y6D0 94 aa10.13□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa10.12□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa10.12□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 NKX2-6A6NCS4 301 aa10.12□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 C17orf112F2Z3M2 114 aa10.12□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 K7EQM0 130 aa10.12□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 NUDT3O95989 172 aa10.12□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 LIPFP07098 398 aa10.12□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 MDH2P40926 338 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 RELBQ01201 579 aa10.12□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 FAM58AQ8N1B3 248 aa10.12□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 SLC39A9Q9NUM3 307 aa10.12□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa10.12□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa10.12□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 PMCHP20382 165 aa10.12□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 HERV-K104P63124 156 aa10.12□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa10.12□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 ODF3L1Q8IXM7 274 aa10.12□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 BORCS7Q96B45 105 aa10.12□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 SPIN2AQ99865 258 aa10.12□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa10.12□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa10.12□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 S1PR2O95136 353 aa10.11□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 CLEC3BP05452 202 aa10.11□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 ZP4Q12836 540 aa10.11□□□□□ -0.79
SPIN3-241ENST00000640511 NEGR1Q7Z3B1 354 aa10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms