RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 DLX6P56179 175 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 DGCR2P98153 550 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 HMGN3Q15651 99 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF79Q15937 498 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 CR1LQ2VPA4 569 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 LINC00299Q6ZSB3 139 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 VMO1Q7Z5L0 202 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 HOGA1Q86XE5 327 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 Q8N7P7 452 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 BEST4Q8NFU0 473 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 OR52I2Q8NH67 350 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 OR1L1Q8NH94 360 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 RFESDQ8TAC1 157 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 GPX8Q8TED1 209 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 IL1F10Q8WWZ1 152 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 S100ZQ8WXG8 99 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 KIRREL1Q96J84 757 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 DMRTB1Q96MA1 342 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 SMR3AQ99954 134 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF286AQ9HBT8 521 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 AKIP1Q9NQ31 210 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 KPTNQ9Y664 436 aa6.99□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 FAM172BPA6NC97 362 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 FABP7O15540 132 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 MMP23AO75900 390 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 SCTP09683 121 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 GSTT2P0CG29 244 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 GSTT2BP0CG30 244 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 IGHV1-8P0DP01 117 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 IGHV3-43DP0DP04 118 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 NFYBP25208 207 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 GDNFP39905 211 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 KIR2DS4P43632 304 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 ARPC4P59998 168 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF45Q02386 682 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 PAX8Q06710 450 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 KRTAP1-1Q07627 177 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 KIR2DS1Q14954 304 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 OR52W1Q6IF63 320 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 HEPN1Q6WQI6 88 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF554Q86TJ5 538 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 Q8N402 240 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 MFSD4AQ8N468 514 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 C11orf42Q8N5U0 333 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 SMIM4Q8WVI0 70 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 GALMQ96C23 342 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 SUCNR1Q9BXA5 334 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 SRRQ9GZT4 340 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 SIRPDQ9H106 197 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 C7orf69Q9H7B7 122 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 RAB9BQ9NP90 201 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 SIRT7Q9NRC8 400 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 KLK11Q9UBX7 282 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 ANXA10Q9UJ72 324 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 KCNS2Q9ULS6 477 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 AUP1Q9Y679 476 aa6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 J3QLI3 93 aa6.97□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 F2RL2O00254 374 aa6.97□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 BET1O15155 118 aa6.97□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 RBBP9O75884 186 aa6.97□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 IGHV3-7P01780 117 aa6.97□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 RBP4P02753 201 aa6.97□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 MMP9P14780 707 aa6.97□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 FOSL1P15407 271 aa6.97□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 COX7A1P24310 79 aa6.97□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 FPR2P25090 351 aa6.97□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 HLA-DMAP28067 261 aa6.97□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 RCVRNP35243 200 aa6.97□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 ACTBP60709 375 aa6.97□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 ACTG1P63261 375 aa6.97□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 GNMTQ14749 295 aa6.97□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 CHRFAM7AQ494W8 412 aa6.97□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 IGSF11Q5DX21 431 aa6.97□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 Q6ZS49 121 aa6.97□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa6.97□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 PDZD9Q8IXQ8 264 aa6.97□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 OR10A7Q8NGE5 316 aa6.97□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 OR52L2PQ8NGH6 319 aa6.97□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 OR10V1Q8NGI7 309 aa6.97□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 OR4A4PQ8NGN8 299 aa6.97□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 SNAPC3Q92966 411 aa6.97□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 LEAP2Q969E1 77 aa6.97□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 LHX4Q969G2 390 aa6.97□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 TBX15Q96SF7 602 aa6.97□□□□□ -1.29
SGMS1-211ENST00000626236 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
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