RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 FAM58AQ8N1B3 248 aa11.33□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 OR8G5Q8NG78 346 aa11.33□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 JMJD7P0C870 316 aa11.33□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 ITGA3P26006 1051 aa11.33□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 MAS1LP35410 378 aa11.33□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 ARR3P36575 388 aa11.33□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 VAMP2P63027 116 aa11.33□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 BAXQ07812 192 aa11.33□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 OR1J1Q8NGS3 322 aa11.33□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 ATP5SQ99766 215 aa11.33□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 IL17BQ9UHF5 180 aa11.33□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP11.33□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 GPR179Q6PRD1 2367 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 H0YL77 283 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 TXNL1O43396 289 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 CELA3BP08861 270 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 MMP9P14780 707 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 LINC00596Q86U02 117 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 OR1K1Q8NGR3 316 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 UBALD1Q8TB05 177 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 IFT22Q9H7X7 185 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 IGKV1-5P01602 117 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 CTXN2P0C2S0 81 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 OR8U8P0C7N1 319 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 PLA2G5P39877 138 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 MEOX1P50221 254 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 ARL16Q0P5N6 197 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 HAPLN4Q86UW8 402 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 MDP1Q86V88 176 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 MALSU1Q96EH3 234 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 KIAA1456Q9P272 454 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 LNP1A1A4G5 178 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 GNG3P63215 75 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 SSX7Q7RTT5 188 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 SLC16A13Q7RTY0 426 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 CMTM1Q8IZ96 169 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 MDS2Q8NDY4 140 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 CLDND2Q8NHS1 167 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 MUCL1Q96DR8 90 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF727A8MUV8 499 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 ERVS71-1P61550 626 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 SOHLH1Q5JUK2 328 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 RNFT1Q5M7Z0 435 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF561Q8N587 486 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 OR10J5Q8NHC4 309 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 STRADBQ9C0K7 418 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 VSIRQ9H7M9 311 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 MPC1Q9Y5U8 109 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 OR5B21A6NL26 309 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 H3BQ15 152 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 WNT2P09544 360 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 MPLP40238 635 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 OR2B8PP59922 312 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF585BQ52M93 769 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF573Q86YE8 665 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 IL1F10Q8WWZ1 152 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 RAB39BQ96DA2 213 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 HIPK2Q9H2X6 1198 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 PLK3Q9H4B4 646 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 SPRR3Q9UBC9 169 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 GTF3C1Q12789 2109 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 PLGLB1Q02325 96 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 ALKBH6Q3KRA9 238 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF506Q5JVG8 444 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 HEPN1Q6WQI6 88 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 PKIBQ9C010 78 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 OPA3Q9H6K4 179 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 SELEP16581 610 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 TAS2R30P59541 319 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 ERVK11-1P61568 191 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 B2MP61769 119 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 FABP9Q0Z7S8 132 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF726P1Q15940 193 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 OR10V1Q8NGI7 309 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 RSG1Q9BU20 258 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 FAM186AA6NE01 2351 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 SIRPB1O00241 398 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 WRBO00258 174 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 OR2H2O95918 312 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 SP1P08047 785 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF883P0CG24 379 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 APLNRP35414 380 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 ADAM5Q6NVV9 412 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF343Q6P1L6 599 aa11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.2 ms