RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609525.1

CSNK2A1-208, Transcript of casein kinase 2 alpha 1, human

TSL 5

Gene CSNK2A1, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PMP2	P02689	132 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FOLR1	P15328	257 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GNB3	P16520	340 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF708	P17019	499 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CD80	P33681	288 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CDKN1A	P38936	164 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	OR1D4	P47884	311 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NPBWR1	P48145	328 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CSNK1A1	P48729	337 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	P2RY4	P51582	365 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	UCN	P55089	124 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TMEM50B	P56557	158 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TMEM33	P57088	247 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KHDC3L	Q587J8	217 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C10orf128	Q5T292	105 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SYT13	Q7L8C5	426 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ACBD4	Q8NC06	268 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SPTSSA	Q969W0	71 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TMEM230	Q96A57	120 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	AMELY	Q99218	206 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NICN1	Q9BSH3	213 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	OR8D2	Q9GZM6	311 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FAM60A	Q9NP50	221 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CENPM	Q9NSP4	180 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	EHF	Q9NZC4	300 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DKKL1	Q9UK85	242 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525		V9GYS6	101 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	APC2	O95996	2303 aa		3.88	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ACACA	Q13085	2346 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525		A0A1B0GTH9	108 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525		A0A1B0GX78	115 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GJE1	A6NN92	205 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LMO7DN	F2Z398	122 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525		H3BMH7	237 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TP53I11	O14683	189 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	IGHV2-70	P01814	119 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	AMBP	P02760	352 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SERPINA5	P05154	406 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	OR8U9	P0C7N5	309 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PGA4	P0DJD7	388 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	THEGL	P0DJG4	465 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	OR5H8	P0DN80	308 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PVR	P15151	417 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF43	P17038	809 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MSR1	P21757	451 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SFTPD	P35247	375 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CD200	P41217	278 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LPAR6	P43657	344 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HTR5A	P47898	357 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CAMLG	P49069	296 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ARHGDIB	P52566	201 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TAS2R30	P59541	319 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PCBD1	P61457	104 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LCN6	P62502	163 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HIST1H3A	P68431	136 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DLK1	P80370	383 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SERF2	P84101	59 aa		3.87	□□□□□ -1.79

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