RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 APOA1P02647 267 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 CLEC2LP0C7M8 214 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF728P0DKX0 622 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 PRTN3P24158 256 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 CHATP28329 748 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 GLP1RP43220 463 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 IFITM3Q01628 133 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 ARFRP1Q13795 201 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF79Q15937 498 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 GPR157Q5UAW9 335 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 STEAP3Q658P3 488 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 OR10K2Q6IF99 312 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 RNF144BQ7Z419 303 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 SAMD12Q8N8I0 201 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 LY6G5BQ8NDX9 201 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 OR4S1Q8NGB4 309 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 OR10A7Q8NGE5 316 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 OR13D1Q8NGV5 346 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 CORO2AQ92828 525 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 CREB3L1Q96BA8 519 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 LPAR5Q9H1C0 372 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 ABCG5Q9H222 651 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 MIXL1Q9H2W2 232 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 COMMD3Q9UBI1 195 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF548-208ENST00000597576 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.4□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 FABP12A6NFH5 140 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 FAM25AB3EWG3 89 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 FAM25CB3EWG5 89 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 FAM25GB3EWG6 89 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 C22orf46C9J442 243 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 G3V4G9 280 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 M0QZ24 198 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 XRCC3O43542 346 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 ORC5O43913 435 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 RGS11O94810 467 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 IL7P13232 177 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 AMY2BP19961 511 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 FPR2P25090 351 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 KIR2DS4P43632 304 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 CBX5P45973 191 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 BCAP31P51572 246 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 ARHGDIBP52566 201 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 GNG2P59768 71 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 PAX8Q06710 450 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 AESQ08117 197 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 ASAH1Q13510 395 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 KIR2DS1Q14954 304 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 TMEM69Q5SWH9 247 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 HACD4Q5VWC8 232 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 CNIH2Q6PI25 160 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 FAM131AQ6UXB0 335 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF497Q6ZNH5 498 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 REC114Q7Z4M0 266 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 BPIFB2Q8N4F0 458 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 OR4M1Q8NGD0 313 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 DIRAS2Q96HU8 199 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 KIF25Q9UIL4 384 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa6.38□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa6.38□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 A0A1B0GW55 424 aa6.38□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 UBE2QL1A1L167 161 aa6.38□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 SOCS1O15524 211 aa6.38□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 TSPAN15O95858 294 aa6.38□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 PAHP00439 452 aa6.38□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 MT-ND4P03905 459 aa6.38□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 LPLP06858 475 aa6.38□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 DUX4L2P0CJ85 424 aa6.38□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 DUX4L3P0CJ86 424 aa6.38□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 DUX4L4P0CJ87 422 aa6.38□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 DUX4L5P0CJ88 424 aa6.38□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 DUX4L6P0CJ89 424 aa6.38□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 DUX4L7P0CJ90 424 aa6.38□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 SELLP14151 372 aa6.38□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 DTYMKP23919 212 aa6.38□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 LGALS4P56470 323 aa6.38□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 LOXL3P58215 753 aa6.38□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP10-3P60369 221 aa6.38□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 ARF6P62330 175 aa6.38□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 TRIQKQ629K1 86 aa6.38□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 HEPN1Q6WQI6 88 aa6.38□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 C6orf201Q7Z4U5 140 aa6.38□□□□□ -1.39
ZNF548-208ENST00000597576 RTN4RL2Q86UN3 420 aa6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms