RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589727.5

ATP6V0A1-222, Transcript of ATPase H+ transporting V0 subunit a1, human

TSL 5

Gene ATP6V0A1, Length 664 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TSSK2	Q96PF2	358 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SPACA5	Q96QH8	159 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MBOAT4	Q96T53	435 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GID8	Q9NWU2	228 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727		A0A087WUU8	490 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727		A0A1W2PRQ8	180 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DCTN6	O00399	190 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SOCS2	O14508	198 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CDC42EP2	O14613	210 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	HSD17B6	O14756	317 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	IGHV3-7	P01780	117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	HLA-DQA2	P01906	255 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GABRR1	P24046	479 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	P2RX3	P56373	397 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DGCR6	Q14129	220 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RPEL1	Q2QD12	228 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	IFI44L	Q53G44	452 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	YIPF7	Q8N8F6	280 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CHST6	Q9GZX3	395 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RNF167	Q9H6Y7	350 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	HES4	Q9HCC6	221 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	BATF3	Q9NR55	127 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727		A0A0G2JND7	137 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR5B21	A6NL26	309 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FFAR1	O14842	300 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ARPC3	O15145	178 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF682	O95780	498 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	HLA-DRB1	P01911	266 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TRGV3	P03979	118 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SCT	P09683	121 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ACKR3	P25106	362 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CD1B	P29016	333 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PTGFR	P43088	359 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	UCP3	P55916	312 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RDH10	Q8IZV5	341 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FANK1	Q8TC84	345 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	LEAP2	Q969E1	77 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RITA1	Q96K30	269 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GPR173	Q9NS66	373 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CENPM	Q9NSP4	180 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RHCG	Q9UBD6	479 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	B9D1	Q9UPM9	204 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727		J3KTA2	159 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727		J3QT63	122 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	BMPR1B	O00238	502 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CXCR6	O00574	342 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	IDH3B	O43837	385 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	HAAO	P46952	286 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OMP	P47874	163 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CX3CR1	P49238	355 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ALDH3A2	P51648	485 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MED22	Q15528	200 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MMD	Q15546	238 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ACTBL2	Q562R1	376 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	LELP1	Q5T871	98 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FAHD1	Q6P587	224 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FAM57B	Q71RH2	274 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CORO2A	Q92828	525 aa		4.83	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 107.6 ms