RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF880Q6PDB4 577 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 NLRC3Q7RTR2 1065 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 HOGA1Q86XE5 327 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 LDLRAD3Q86YD5 345 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 BEST4Q8NFU0 473 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 OR56B4Q8NH76 319 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 PPP1R35Q8TAP8 253 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 IL1F10Q8WWZ1 152 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 NINJ1Q92982 152 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 ARL11Q969Q4 196 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
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CAPNS1-208ENST00000589162 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM234AQ9H0X4 552 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 DNTTIP1Q9H147 329 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 SPACA1Q9HBV2 294 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 HRASLSQ9HDD0 168 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 CALYQ9NYX4 217 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 MTFP1Q9UDX5 166 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 TBC1D24Q9ULP9 559 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 DSCAML1Q8TD84 2053 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 LOC105371242A0A075B767 164 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 TRDCB7Z8K6 153 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 NDUFS8O00217 210 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 CTDSPLO15194 276 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 NDUFA2O43678 99 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 CA11O75493 328 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 UPK1BO75841 260 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 RAB3DO95716 219 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF735P0CB33 412 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 PPIAL4GP0DN37 164 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 CGB3P0DN86 165 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 CGB7P0DN87 165 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 IGHV4-31P0DP07 118 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC25A16P16260 332 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 NFYBP25208 207 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 RCVRNP35243 200 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 HRH1P35367 487 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 INPP1P49441 399 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 CCR6P51684 374 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 DSCR9P59020 149 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 PAX2Q02962 417 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 HMGN3Q15651 99 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 KCNJ8Q15842 424 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM189A2Q15884 450 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 GAPTQ8N292 157 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 C11orf42Q8N5U0 333 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 Q8N7P7 452 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 GDPD1Q8N9F7 314 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 OR5D13Q8NGL4 314 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 OR4C16Q8NGL9 310 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 OR5H2Q8NGV7 314 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 GPHA2Q96T91 129 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC6A7Q99884 636 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 SMR3AQ99954 134 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 FOXC2Q99958 501 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 SCPEP1Q9HB40 452 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF286AQ9HBT8 521 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 MCUBQ9NWR8 336 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 EHFQ9NZC4 300 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC23A1Q9UHI7 598 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 ANXA10Q9UJ72 324 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 RNF150Q9ULK6 438 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 ANAPC10Q9UM13 185 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa4.93□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa4.93□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa4.93□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa4.93□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 hADV38S2A0JD32 116 aa4.93□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa4.93□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 SULT1C2O00338 296 aa4.93□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 FSTL3O95633 263 aa4.93□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 AMY2AP04746 511 aa4.93□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 GLAP06280 429 aa4.93□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF728P0DKX0 622 aa4.93□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 IGKV1-13P0DP09 117 aa4.93□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 NAT1P18440 290 aa4.93□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 PI3P19957 117 aa4.93□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 AADACP22760 399 aa4.93□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 DTYMKP23919 212 aa4.93□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP4.93□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 ERP29P30040 261 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 FCGR2CP31995 323 aa4.93□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 BTCP35070 178 aa4.93□□□□□ -1.62
CAPNS1-208ENST00000589162 RANBP1P43487 201 aa4.93□□□□□ -1.62
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