RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564580.5

RRN3P2-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RRN3P2, Length 2,132 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P2-202ENST00000564580 ARG1P05089 322 aa9.28□□□□□ -0.92
RRN3P2-202ENST00000564580 CD34P28906 385 aa9.28□□□□□ -0.92
RRN3P2-202ENST00000564580 HILS1P60008 231 aa9.28□□□□□ -0.92
RRN3P2-202ENST00000564580 LTC4SQ16873 150 aa9.28□□□□□ -0.92
RRN3P2-202ENST00000564580 CDNFQ49AH0 187 aa9.28□□□□□ -0.92
RRN3P2-202ENST00000564580 C6orf183Q5T699 404 aa9.28□□□□□ -0.92
RRN3P2-202ENST00000564580 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
RRN3P2-202ENST00000564580 ZNF880Q6PDB4 577 aa9.28□□□□□ -0.92
RRN3P2-202ENST00000564580 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
RRN3P2-202ENST00000564580 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa9.28□□□□□ -0.92
RRN3P2-202ENST00000564580 OR10A7Q8NGE5 316 aa9.28□□□□□ -0.92
RRN3P2-202ENST00000564580 OR1L1Q8NH94 360 aa9.28□□□□□ -0.92
RRN3P2-202ENST00000564580 LEAP2Q969E1 77 aa9.28□□□□□ -0.92
RRN3P2-202ENST00000564580 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
RRN3P2-202ENST00000564580 ZNF286AQ9HBT8 521 aa9.28□□□□□ -0.92
RRN3P2-202ENST00000564580 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa9.27□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa9.27□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 SERPINE3A8MV23 424 aa9.27□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 F2RL2O00254 374 aa9.27□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 SPINT2O43291 252 aa9.27□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 VENTXO95231 258 aa9.27□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 IGLV1-47P01700 117 aa9.27□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 PAX6P26367 422 aa9.27□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 LGALS4P56470 323 aa9.27□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 CNPY1Q3B7I2 92 aa9.27□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 ZNF554Q86TJ5 538 aa9.27□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 SAMD12Q8N8I0 201 aa9.27□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 ISOC1Q96CN7 298 aa9.27□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 BCL7BQ9BQE9 202 aa9.27□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 ABCG5Q9H222 651 aa9.27□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 PSG11Q9UQ72 335 aa9.27□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 A0A0A6YYJ9 748 aa9.26□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 H3BMQ9 156 aa9.26□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 SCGNO76038 276 aa9.26□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 TRAT1Q6PIZ9 186 aa9.26□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 Q6YL49 198 aa9.26□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 DYNAPQ8N1N2 210 aa9.26□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 ZDHHC22Q8N966 263 aa9.26□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 OR52M1Q8NGK5 317 aa9.26□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 OR4P4Q8NGL7 312 aa9.26□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 DUX5Q96PT3 197 aa9.26□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 KCNIP1Q9NZI2 227 aa9.26□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 ZNRD1Q9P1U0 126 aa9.26□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 COMMD3Q9UBI1 195 aa9.26□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 STAB1Q9NY15 2570 aa9.26□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 POM121CA8CG34 1229 aa9.26□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 FBP1P09467 338 aa9.26□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 LSAMPQ13449 338 aa9.26□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 HACD4Q5VWC8 232 aa9.26□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 ZDHHC16Q969W1 377 aa9.26□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 Q9N2K0 584 aa9.26□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP9.26□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa9.25□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 TMEM235A6NFC5 223 aa9.25□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 J3QR06 171 aa9.25□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 MELTFP08582 738 aa9.25□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 CD3GP09693 182 aa9.25□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 IGHV3-43DP0DP04 118 aa9.25□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 BAMBIQ13145 260 aa9.25□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 ARL6IP1Q15041 203 aa9.25□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 SLC9A3R2Q15599 337 aa9.25□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 HMGN3Q15651 99 aa9.25□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 ZNF260Q3ZCT1 412 aa9.25□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 UBE2NLQ5JXB2 153 aa9.25□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 BEND2Q8NDZ0 799 aa9.25□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 OR9G1Q8NH87 305 aa9.25□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 SETD6Q8TBK2 473 aa9.25□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 ZNF596Q8TC21 504 aa9.25□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 ACOT12Q8WYK0 555 aa9.25□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 PHF21AQ96BD5 680 aa9.25□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 GALMQ96C23 342 aa9.25□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 OR2S2Q9NQN1 319 aa9.25□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 DIABLOQ9NR28 239 aa9.25□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 GFOD1Q9NXC2 390 aa9.25□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 TRAV18A0A075B6X5 111 aa9.25□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 A0A0A6YYH2 397 aa9.25□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 A0A1W2PPE3 182 aa9.25□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa9.25□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 A6NJ64 397 aa9.25□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 TOR1AO14656 332 aa9.25□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 IGHV4-59P01825 116 aa9.25□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 FCGR3AP08637 254 aa9.25□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 IER3P46695 156 aa9.25□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 SSX2Q16385 188 aa9.25□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 HLA-DRB5Q30154 266 aa9.25□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 MOB1BQ7L9L4 216 aa9.25□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 IZUMO1Q8IYV9 350 aa9.25□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 DTX3Q8N9I9 347 aa9.25□□□□□ -0.93
RRN3P2-202ENST00000564580 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms