RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200		M0QZK8	103 aa		17.32	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	17.32	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	GLA	P06280	429 aa		17.32	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	LPL	P06858	475 aa		17.32	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	CD83	Q01151	205 aa		17.32	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	17.32	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	17.32	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		17.32	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	17.32	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		17.32	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	ETAA1	Q9NY74	926 aa		17.32	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	17.31	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	CA11	O75493	328 aa		17.31	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	FUT3	P21217	361 aa		17.31	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	MED22	Q15528	200 aa		17.31	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200		Q3ZCU0	254 aa		17.31	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		17.31	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		17.31	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		17.31	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		17.31	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		17.31	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	HSD17B6	O14756	317 aa		17.3	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	C1QL4	Q86Z23	238 aa		17.3	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		17.3	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	OR4K15	Q8NH41	348 aa		17.3	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		17.3	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM46B	Q96A09	425 aa		17.3	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		17.3	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		17.3	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	UCHL1	P09936	223 aa		17.3	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	UBB	P0CG47	229 aa		17.3	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		17.3	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	17.3	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	SRM	P19623	302 aa		17.3	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	TPBG	Q13641	420 aa		17.3	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	EBI3	Q14213	229 aa		17.3	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		17.3	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		17.3	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	CST11	Q9H112	138 aa		17.3	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	17.3	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		17.29	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	PDCD6	O75340	191 aa		17.29	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	17.29	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	VSIG8	P0DPA2	414 aa		17.29	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	CRHBP	P24387	322 aa		17.29	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF134	P52741	427 aa		17.29	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		17.29	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	17.29	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	C6orf183	Q5T699	404 aa		17.29	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		17.29	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		17.29	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	17.29	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		17.29	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	UBE2QL1	A1L167	161 aa		17.28	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200		G3V4G9	280 aa		17.28	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	CCRL2	O00421	344 aa		17.28	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC31A2	O15432	143 aa		17.28	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	SPINT2	O43291	252 aa		17.28	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	RGS10	O43665	173 aa		17.28	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	IGKV1D-33	P01593	117 aa		17.28	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	IGKV1-33	P01594	117 aa		17.28	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	HBZ	P02008	142 aa		17.28	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM11	P17152	192 aa		17.28	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF137P	P52743	207 aa		17.28	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		17.28	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	OR10K2	Q6IF99	312 aa		17.28	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		17.28	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		17.28	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	17.28	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		17.28	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	OR1L1	Q8NH94	360 aa		17.28	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	17.28	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	UFD1	Q92890	307 aa		17.28	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM203	Q969S6	136 aa		17.28	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	R3HDM4	Q96D70	268 aa		17.28	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	OR4F4	Q96R69	305 aa		17.28	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		17.28	■□□□□ 0.36
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC22A1	O15245	554 aa		17.27	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	FGF16	O43320	207 aa		17.27	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	MPIG6B	O95866	241 aa		17.27	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	CHAT	P28329	748 aa		17.27	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	REG1B	P48304	166 aa		17.27	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	17.27	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	QRFP	P83859	136 aa		17.27	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	UNC119	Q13432	240 aa		17.27	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	HES1	Q14469	280 aa		17.27	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	HNF4G	Q14541	408 aa		17.27	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		17.27	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		17.27	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	17.27	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		17.27	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		17.27	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		17.27	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200		Q8N6K4	173 aa		17.27	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		17.27	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	17.27	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		17.27	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	17.26	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		17.26	■□□□□ 0.35
PPP4C-205	ENST00000563200	GFI1	Q99684	422 aa		17.26	■□□□□ 0.35

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