RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-208ENST00000560725 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 REEP3Q6NUK4 255 aa4.18□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa4.18□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 C12orf54Q6X4T0 127 aa4.18□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 MDP1Q86V88 176 aa4.18□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 C20orf196Q8IYI0 205 aa4.18□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 C6orf223Q8N319 242 aa4.18□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 OR4C5Q8NGB2 326 aa4.18□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 OR6N1Q8NGY5 312 aa4.18□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 C7orf33Q8WU49 177 aa4.18□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 OR2M2Q96R28 347 aa4.18□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 MBOAT4Q96T53 435 aa4.18□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 CENPHQ9H3R5 247 aa4.18□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP4.18□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 SLC25A22Q9H936 323 aa4.18□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 NOX3Q9HBY0 568 aa4.18□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 NEK6Q9HC98 313 aa4.18□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 GMEB1Q9Y692 573 aa4.18□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 SONP18583 2426 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 VPS13CQ709C8 3753 aa4.18□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 ATRQ13535 2644 aa4.18□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 A0A1B0GWA3 101 aa4.17□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 EVPLLA8MZ36 301 aa4.17□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 M0R3G1 203 aa4.17□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 AGPAT2O15120 278 aa4.17□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 FARS2O95363 451 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 HLA-HP01893 362 aa4.17□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 SERPINA5P05154 406 aa4.17□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 MSMBP08118 114 aa4.17□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 OR8G3PP0DMU2 310 aa4.17□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 CD79AP11912 226 aa4.17□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 GRPRP30550 384 aa4.17□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 NCALDP61601 193 aa4.17□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 CDK6Q00534 326 aa4.17□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 PMS2P3Q13401 168 aa4.17□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 C1orf174Q8IYL3 243 aa4.17□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 OR51F2Q8NH61 342 aa4.17□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 OR6X1Q8NH79 312 aa4.17□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 SGMS2Q8NHU3 365 aa4.17□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 GTF2H4Q92759 462 aa4.17□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 C16orf74Q96GX8 76 aa4.17□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF75AQ96N20 296 aa4.17□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 OR8B4Q96RC9 309 aa4.17□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 ULBP2Q9BZM5 246 aa4.17□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 RACGAP1Q9H0H5 632 aa4.17□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 C1orf198Q9H425 327 aa4.17□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 TMEM38AQ9H6F2 299 aa4.17□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa4.17□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 CDH10Q9Y6N8 788 aa4.17□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 DNHD1Q96M86 4753 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 A0A0B4J2E0 115 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 A0A1B0GX12 115 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 TMEM120BA0PK00 339 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 CENPBD1B2RD01 187 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 J3QLI3 93 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 PLPP3O14495 311 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 MMP23AO75900 390 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 BGLAPP02818 100 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF250P15622 560 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 GPX2P18283 190 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 COX7A1P24310 79 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 COL8A2P25067 703 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 CSNK1A1P48729 337 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 TAS2R19P59542 299 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 HOXC5Q00444 222 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 OR1Q1Q15612 314 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 AGBL2Q5U5Z8 902 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 TMEM53Q6P2H8 277 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 EPGNQ6UW88 154 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 C19orf35Q6ZS72 473 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 SLC30A8Q8IWU4 369 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 SLC22A24Q8N4F4 322 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 C3orf56Q8N813 242 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 OR5J2Q8NH18 312 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 CLDND2Q8NHS1 167 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 C11orf40Q8WZ69 217 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 TMEM54Q969K7 222 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 MAL2Q969L2 176 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 MARC2Q969Z3 335 aa4.16□□□□□ -1.74
TMOD3-208ENST00000560725 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms