RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559551.5

RABGGTA-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, human

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 2,060 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTA-209	ENST00000559551	SDSL	Q96GA7	329 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RABGGTA-209	ENST00000559551	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RABGGTA-209	ENST00000559551	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RABGGTA-209	ENST00000559551	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RABGGTA-209	ENST00000559551	EHF	Q9NZC4	300 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RABGGTA-209	ENST00000559551	VSIG4	Q9Y279	399 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RABGGTA-209	ENST00000559551	DISC1	C4P0D8	188 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RABGGTA-209	ENST00000559551	RP2	O75695	350 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RABGGTA-209	ENST00000559551	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RABGGTA-209	ENST00000559551	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
RABGGTA-209	ENST00000559551	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
RABGGTA-209	ENST00000559551	GLIPR1	P48060	266 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RABGGTA-209	ENST00000559551	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
RABGGTA-209	ENST00000559551	TAS2R46	P59540	309 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RABGGTA-209	ENST00000559551	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	11.91	□□□□□ -0.5
RABGGTA-209	ENST00000559551	ACTBL2	Q562R1	376 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RABGGTA-209	ENST00000559551	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
RABGGTA-209	ENST00000559551	CCL13	Q99616	98 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RABGGTA-209	ENST00000559551	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RABGGTA-209	ENST00000559551	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
RABGGTA-209	ENST00000559551	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RABGGTA-209	ENST00000559551	CENPE	Q02224	2701 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RABGGTA-209	ENST00000559551	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
RABGGTA-209	ENST00000559551		A1L4Q6	167 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RABGGTA-209	ENST00000559551	OR5H14	A6NHG9	310 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RABGGTA-209	ENST00000559551		K7N7A8	449 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RABGGTA-209	ENST00000559551		L7N2F9	121 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RABGGTA-209	ENST00000559551	LGALS8	O00214	317 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RABGGTA-209	ENST00000559551	NDUFS7	O75251	213 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RABGGTA-209	ENST00000559551	B3GALNT1	O75752	331 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RABGGTA-209	ENST00000559551	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
RABGGTA-209	ENST00000559551	CDKN1A	P38936	164 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RABGGTA-209	ENST00000559551	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
RABGGTA-209	ENST00000559551	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
RABGGTA-209	ENST00000559551	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RABGGTA-209	ENST00000559551	UBALD1	Q8TB05	177 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RABGGTA-209	ENST00000559551	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RABGGTA-209	ENST00000559551	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RABGGTA-209	ENST00000559551	IRF2	P14316	349 aa		11.9	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	PAX5	Q02548	391 aa		11.9	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	ZMYND11	Q15326	602 aa		11.9	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		11.9	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		11.9	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		11.9	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		11.9	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		11.9	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	SNX22	Q96L94	193 aa		11.9	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	LINC00052	Q96N35	136 aa		11.9	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	PRRT1	Q99946	306 aa		11.9	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		11.9	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	LRRC30	A6NM36	301 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	TRDC	B7Z8K6	153 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	PPIAL4D	F5H284	164 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	OR5H8	P0DN80	308 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	BTN1A1	Q13410	526 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	TERB2	Q8NHR7	220 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	ARID1A	O14497	2285 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551		A8MXK9	166 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	TK1	P04183	234 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	IFNA6	P05013	189 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	NPY4R	P50391	375 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	HLA-DRB3	P79483	266 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	ZNF273	Q14593	569 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	SIGLEC5	O15389	551 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	IL5	P05113	134 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	KCNJ3	P48549	501 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	EDDM3A	Q14507	147 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	HMGN3	Q15651	99 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	TCF23	Q7RTU1	214 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	OR2A4	O95047	310 aa		11.87	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	CXCL2	P19875	107 aa		11.87	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
RABGGTA-209	ENST00000559551	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		11.87	□□□□□ -0.51

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms