RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552931.1

SMARCC2-215, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin subfamily c member 2, human

TSL 3

Gene SMARCC2, Length 608 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMARCC2-215	ENST00000552931	IL1A	P01583	271 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCC2-215	ENST00000552931	PRKACA	P17612	351 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCC2-215	ENST00000552931	GABRR1	P24046	479 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCC2-215	ENST00000552931	CDK2	P24941	298 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCC2-215	ENST00000552931	GLIPR1	P48060	266 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCC2-215	ENST00000552931	RAB7A	P51149	207 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCC2-215	ENST00000552931	GMFB	P60983	142 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCC2-215	ENST00000552931	SLC34A1	Q06495	639 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCC2-215	ENST00000552931	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SMARCC2-215	ENST00000552931	MED21	Q13503	144 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCC2-215	ENST00000552931	SSX2	Q16385	188 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCC2-215	ENST00000552931	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCC2-215	ENST00000552931		Q499Y3	187 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCC2-215	ENST00000552931	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCC2-215	ENST00000552931	COMMD1	Q8N668	190 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCC2-215	ENST00000552931	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCC2-215	ENST00000552931	STPG3	Q8N7X2	389 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCC2-215	ENST00000552931	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCC2-215	ENST00000552931	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCC2-215	ENST00000552931	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCC2-215	ENST00000552931	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SMARCC2-215	ENST00000552931	TMEM106A	Q96A25	262 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCC2-215	ENST00000552931	OR4F4	Q96R69	305 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCC2-215	ENST00000552931	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SMARCC2-215	ENST00000552931	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCC2-215	ENST00000552931	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCC2-215	ENST00000552931	RAB9B	Q9NP90	201 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCC2-215	ENST00000552931	DHDH	Q9UQ10	334 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCC2-215	ENST00000552931	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCC2-215	ENST00000552931	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SMARCC2-215	ENST00000552931	EFCAB10	A6NFE3	127 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	NOTO	A8MTQ0	251 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	C15orf65	H3BRN8	121 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931		J3QR06	171 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	GABRP	O00591	440 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	FAM106CP	P0CH98	169 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	TMEM225B	P0DP42	221 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	BDKRB2	P30411	391 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	MC5R	P33032	325 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	MNDA	P41218	407 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	RANBP1	P43487	201 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	POU3F4	P49335	361 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	ETV1	P50549	477 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	LOXL3	P58215	753 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	BLCAP	P62952	87 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	AES	Q08117	197 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	DOC2B	Q14184	412 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	ODF4	Q2M2E3	257 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	MAJIN	Q3KP22	176 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	CST9LP1	Q5W188	147 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	RNF144B	Q7Z419	303 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	SPART	Q8N0X7	666 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931		Q8N6K4	173 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	PHYHIP	Q92561	330 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	GGH	Q92820	318 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	GHSR	Q92847	366 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	TMEM80	Q96HE8	168 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	CHST6	Q9GZX3	395 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	METTL9	Q9H1A3	318 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	FBXL17	Q9UF56	701 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	LRRC42	Q9Y546	428 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931		A0A1W2PPI3	338 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931		A0A1W2PRD5	423 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931		A0A1W2PRF3	423 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931		A0A1W2PRM7	423 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	ITGB1BP1	O14713	200 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	TSPAN15	O95858	294 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	LALBA	P00709	142 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	IGHG2	P01859	326 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	MT-ND4	P03905	459 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	HCK	P08631	526 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	OCM2	P0CE71	109 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	GTF2F2	P13984	249 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	ZNF44	P15621	663 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	MYL12A	P19105	171 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	COX7A1	P24310	79 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	DUSP1	P28562	367 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	CD1B	P29016	333 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	RAP2B	P61225	183 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	MADCAM1	Q13477	382 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	RIPK1	Q13546	671 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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