RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 METTL11BQ5VVY1 283 aa7.69□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 NCR3LG1Q68D85 454 aa7.69□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 STEAP1BQ6NZ63 245 aa7.69□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 LPCAT3Q6P1A2 487 aa7.69□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 OVCH2Q7RTZ1 564 aa7.69□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 RTN4RL2Q86UN3 420 aa7.69□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 LYSMD2Q8IV50 215 aa7.69□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 C8orf31Q8N9H6 132 aa7.69□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 OR13A1Q8NGR1 328 aa7.69□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 OR6F1Q8NGZ6 308 aa7.69□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 MRGPRDQ8TDS7 321 aa7.69□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 TNFRSF14Q92956 283 aa7.69□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 TRIM63Q969Q1 353 aa7.69□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 CREB3L1Q96BA8 519 aa7.69□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 GINS4Q9BRT9 223 aa7.69□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 CABLES2Q9BTV7 478 aa7.69□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 TOLLIPQ9H0E2 274 aa7.69□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa7.69□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 OR2S2Q9NQN1 319 aa7.69□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 ABCB10Q9NRK6 738 aa7.69□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 C19orf12Q9NSK7 152 aa7.69□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 ING3Q9NXR8 418 aa7.69□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 CALYQ9NYX4 217 aa7.69□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa7.69□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 CREBBPQ92793 2442 aa7.69□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 FBN2P35556 2912 aa7.68□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa7.68□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa7.68□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 A0A1B0GW55 424 aa7.68□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 RNF223E7ERA6 249 aa7.68□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 C15orf65H3BRN8 121 aa7.68□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 YPEL1O60688 119 aa7.68□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 HBZP02008 142 aa7.68□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 TFF1P04155 84 aa7.68□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 FCER2P06734 321 aa7.68□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 GSTT2P0CG29 244 aa7.68□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 DUX4L2P0CJ85 424 aa7.68□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 DUX4L3P0CJ86 424 aa7.68□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 DUX4L4P0CJ87 422 aa7.68□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 DUX4L5P0CJ88 424 aa7.68□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 DUX4L6P0CJ89 424 aa7.68□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 DUX4L7P0CJ90 424 aa7.68□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 OR5H8P0DN80 308 aa7.68□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 PTHLHP12272 177 aa7.68□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 HLA-DMAP28067 261 aa7.68□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 RAB7AP51149 207 aa7.68□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 PRRX1P54821 245 aa7.68□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 ASAH1Q13510 395 aa7.68□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 BAK1Q16611 211 aa7.68□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 CYB5R2Q6BCY4 276 aa7.68□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 DHRS11Q6UWP2 260 aa7.68□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 GLCCI1Q86VQ1 547 aa7.68□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 TPRX1Q8N7U7 411 aa7.68□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 OR13D1Q8NGV5 346 aa7.68□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 ZFAND2BQ8WV99 257 aa7.68□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 GIMAP1Q8WWP7 306 aa7.68□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 KIRREL1Q96J84 757 aa7.68□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 YPEL2Q96QA6 119 aa7.68□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 GNG12Q9UBI6 72 aa7.68□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 DUX4Q9UBX2 424 aa7.68□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 SESN1Q9Y6P5 492 aa7.68□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP7.68□□□□□ -1.181e-12■■■■■ 34.1
CS-220ENST00000550700 CCDC168Q8NDH2 2452 aa7.68□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 PDZD2O15018 2839 aa7.67□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 A0A087X0M5 115 aa7.67□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 A0A096LNT2 108 aa7.67□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 A0A1B0GX30 115 aa7.67□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 MEIS3P1A6NDR6 274 aa7.67□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 J3QRK9 145 aa7.67□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 LYRM1O43325 122 aa7.67□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 CD3DP04234 171 aa7.67□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 PRTN3P24158 256 aa7.67□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 S100GP29377 79 aa7.67□□□□□ -1.18
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CS-220ENST00000550700 BPIFB3P59826 476 aa7.67□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 LCN2P80188 198 aa7.67□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 MADCAM1Q13477 382 aa7.67□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 MSMO1Q15800 293 aa7.67□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 C17orf58Q2M2W7 97 aa7.67□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 C11orf88Q6PI97 169 aa7.67□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa7.67□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 GVQW1Q8N7I0 195 aa7.67□□□□□ -1.18
CS-220ENST00000550700 TERB2Q8NHR7 220 aa7.67□□□□□ -1.18
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