RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 TP53RKQ96S44 253 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 SHARPINQ9H0F6 387 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 IFT22Q9H7X7 185 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 RNF7Q9UBF6 113 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 IL19Q9UHD0 177 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 C17orf100A8MU93 164 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 C12orf77C9JDV5 145 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 SCGB1D2O95969 90 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 GYPAP02724 150 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 GLAP06280 429 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 CTXN2P0C2S0 81 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 MDH2P40926 338 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 ECI1P42126 302 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 NCMAPQ5T1S8 102 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 LYZL2Q7Z4W2 148 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 FAM90A1Q86YD7 464 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 GALNT11Q8NCW6 608 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 OR52L2PQ8NGH6 319 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 OR4A4PQ8NGN8 299 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 OR13A1Q8NGR1 328 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 ARL11Q969Q4 196 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 GALMQ96C23 342 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 PIK3IP1Q96FE7 263 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 CCL13Q99616 98 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 MFFQ9GZY8 342 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 NAA60Q9H7X0 242 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 OR2S2Q9NQN1 319 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 PCDHB10Q9UN67 800 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 OR2W1Q9Y3N9 320 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 MAB21L2Q9Y586 359 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 H7C1Q1 480 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 ERVH48-1M5A8F1 160 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 TMPRSS2O15393 492 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 MPPED1O15442 326 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 TBC1D26Q86UD7 250 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 LDLRAD3Q86YD5 345 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 CMTM1Q8IZ96 169 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 GLYATL2Q8WU03 294 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 MBD2Q9UBB5 411 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 SVEP1Q4LDE5 3571 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 DBX1A6NMT0 343 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 SIAH2O43255 324 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 RGS11O94810 467 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 HBZP02008 142 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 TNFRSF1AP19438 455 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 LMO1P25800 156 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 GNMTQ14749 295 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 LPCAT3Q6P1A2 487 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 Q6ZS49 121 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 FGFRL1Q8N441 504 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 FAM216BQ8N7L0 139 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 THAP6Q8TBB0 222 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 NINJ1Q92982 152 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 A0A1B0GWJ7 208 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 ZNF737O75373 536 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 TUSC2O75896 110 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 RPA2P15927 270 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 PLA2G5P39877 138 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 TMEM268Q5VZI3 342 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 LRRC46Q96FV0 321 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 GON7Q9BXV9 100 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 RAB18Q9NP72 206 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 LRRK2Q5S007 2527 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 CENPEQ02224 2701 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 LYNX1G3V0Z9 82 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 IFNL4K9M1U5 179 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 GPR31O00270 319 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 NXPH3O95157 252 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 MPC2O95563 127 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 IFNA21P01568 189 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 LYNX1P0DP58 116 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 PSMB6P28072 239 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 RAB32Q13637 225 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 OPCMLQ14982 345 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 TESK1Q15569 626 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 GGNBP1Q5YKI7 109 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 C11orf87Q6NUJ2 197 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 ZNF880Q6PDB4 577 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 ANGPTL6Q8NI99 470 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 LHFPL5Q8TAF8 219 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 RSRP1Q9BUV0 290 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-215ENST00000549143 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
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CS-215ENST00000549143 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa7.03□□□□□ -1.28
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