RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542777.1

DDX11-222, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

TSL 2

Gene DDX11, Length 489 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-222	ENST00000542777	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		12.62	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	12.62	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	LINC00596	Q86U02	117 aa		12.62	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777		Q8N6K4	173 aa		12.62	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777		Q8N9W7	124 aa		12.62	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	NEK7	Q8TDX7	302 aa		12.62	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	RAX2	Q96IS3	184 aa		12.62	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		12.62	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	GON7	Q9BXV9	100 aa		12.62	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		12.62	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	12.62	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	12.62	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		12.62	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	12.61	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	ORC5	O43913	435 aa		12.61	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	MT-ND4	P03905	459 aa		12.61	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	IL3RA	P26951	378 aa		12.61	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	CD1B	P29016	333 aa		12.61	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	BDKRB2	P30411	391 aa		12.61	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	ETV1	P50549	477 aa		12.61	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	12.61	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	GPR50	Q13585	617 aa		12.61	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	DOC2B	Q14184	412 aa		12.61	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	MPV17L	Q2QL34	196 aa		12.61	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	12.61	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		12.61	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		12.61	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	12.61	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		12.61	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	ORAI1	Q96D31	301 aa		12.61	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777		A0A1W2PP11	408 aa		12.6	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	RAMP3	O60896	148 aa		12.6	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	12.6	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	MOS	P00540	346 aa		12.6	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		12.6	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		12.6	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		12.6	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		12.6	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	STX19	Q8N4C7	294 aa		12.6	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM104	Q8NE00	496 aa		12.6	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		12.6	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	GGH	Q92820	318 aa		12.6	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	CNBD2	Q96M20	576 aa		12.6	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	S1PR3	Q99500	378 aa		12.6	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	12.6	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		12.6	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		12.6	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	12.6	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		12.6	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	12.59	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	AIP	O00170	330 aa		12.59	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	SLC31A2	O15432	143 aa		12.59	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	OGG1	O15527	345 aa		12.59	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	ELANE	P08246	267 aa		12.59	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	GTF2F2	P13984	249 aa		12.59	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	DCK	P27707	260 aa		12.59	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	12.59	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	HSPA13	P48723	471 aa		12.59	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	FOXE3	Q13461	319 aa		12.59	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	KIR2DS1	Q14954	304 aa		12.59	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	DEFB136	Q30KP8	78 aa		12.59	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777		Q3ZCU0	254 aa		12.59	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		12.59	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		12.59	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	OR8U1	Q8NH10	309 aa		12.59	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		12.59	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		12.59	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		12.59	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		12.59	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	RAB26	Q9ULW5	256 aa		12.59	□□□□□ -0.39
DDX11-222	ENST00000542777	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		12.58	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	SPINT2	O43291	252 aa		12.58	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	12.58	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	12.58	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	F2RL1	P55085	397 aa		12.58	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	GPR176	Q14439	515 aa		12.58	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	12.58	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		12.58	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	12.58	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	RNF152	Q8N8N0	203 aa		12.58	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		12.58	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		12.58	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	SMIM19	Q96E16	107 aa		12.58	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	12.58	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		12.58	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		12.58	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	GNG12	Q9UBI6	72 aa		12.58	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		12.58	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	C12orf77	C9JDV5	145 aa		12.57	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	TXNL1	O43396	289 aa		12.57	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	GPX5	O75715	221 aa		12.57	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	12.57	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	VDAC1	P21796	283 aa		12.57	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	SOX6	P35712	828 aa		12.57	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF134	P52741	427 aa		12.57	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		12.57	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	AHSA2	Q719I0	299 aa		12.57	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		12.57	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		12.57	□□□□□ -0.4
DDX11-222	ENST00000542777	OR4K15	Q8NH41	348 aa		12.57	□□□□□ -0.4

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