RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541025.2

TTR-203, Transcript of transthyretin, humanhuman

TSL 2

Gene TTR, Length 956 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTR-203ENST00000541025 GABRPO00591 440 aa5.13□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 MYL12BO14950 172 aa5.13□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 PIN1P1O15428 100 aa5.13□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 KDM4BO94953 1096 aa5.13□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 LIPFP07098 398 aa5.13□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 OCM2P0CE71 109 aa5.13□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 CCL3L1P16619 93 aa5.13□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 PRKACAP17612 351 aa5.13□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 CELP19835 753 aa5.13□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 CRHBPP24387 322 aa5.13□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 OR3A4PP47883 348 aa5.13□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 CAPZA1P52907 286 aa5.13□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 HILS1P60008 231 aa5.13□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 ZNF273Q14593 569 aa5.13□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 INSL4Q14641 139 aa5.13□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 IRF3Q14653 427 aa5.13□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 ZNF146Q15072 292 aa5.13□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 LCE1EQ5T753 118 aa5.13□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 RNLSQ5VYX0 342 aa5.13□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 HCP5Q6MZN7 132 aa5.13□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 C17orf107Q6ZR85 190 aa5.13□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 C9orf139Q6ZV77 190 aa5.13□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 TCF23Q7RTU1 214 aa5.13□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 MKXQ8IYA7 352 aa5.13□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 FAM58AQ8N1B3 248 aa5.13□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 PNKDQ8N490 385 aa5.13□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 BPIFB2Q8N4F0 458 aa5.13□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 ZNF561Q8N587 486 aa5.13□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 C11orf42Q8N5U0 333 aa5.13□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 TEX29Q8N6K0 151 aa5.13□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 OR4M1Q8NGD0 313 aa5.13□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 OR5D14Q8NGL3 314 aa5.13□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa5.13□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 TNFRSF14Q92956 283 aa5.13□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 CDCA4Q9BXL8 241 aa5.13□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 CHST6Q9GZX3 395 aa5.13□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 VCX3BQ9H321 246 aa5.13□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 DUSP21Q9H596 190 aa5.13□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 NEK6Q9HC98 313 aa5.13□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 HMG20AQ9NP66 347 aa5.13□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 SIRT7Q9NRC8 400 aa5.13□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 ZNF581Q9P0T4 197 aa5.13□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 FAM96BQ9Y3D0 163 aa5.13□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa5.12□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 A0A1W2PP11 408 aa5.12□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 A0A1W2PQ09 198 aa5.12□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 A0A1W2PRD5 423 aa5.12□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 A0A1W2PRF3 423 aa5.12□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 A0A1W2PRM7 423 aa5.12□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 IFITM10A6NMD0 228 aa5.12□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa5.12□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 CDRT1O95170 752 aa5.12□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 HAND1O96004 215 aa5.12□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 IGHV1-69P01742 117 aa5.12□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 CD2P06729 351 aa5.12□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 RAB3AP20336 220 aa5.12□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 VHLP40337 213 aa5.12□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 MAP2K4P45985 399 aa5.12□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 OR3A1P47881 315 aa5.12□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 DLX6P56179 175 aa5.12□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 ACSM1Q08AH1 577 aa5.12□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 MED21Q13503 144 aa5.12□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 EDDM3AQ14507 147 aa5.12□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 SPHARQ15513 63 aa5.12□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 DEFB112Q30KQ8 113 aa5.12□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 Q499Y3 187 aa5.12□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 YIF1BQ5BJH7 314 aa5.12□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 FAM27D1Q5T7N8 215 aa5.12□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 DDI2Q5TDH0 399 aa5.12□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 GPR157Q5UAW9 335 aa5.12□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 Q6P435 159 aa5.12□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 Q6ZSV7 163 aa5.12□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 USP43Q70EL4 1123 aa5.12□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 ZNF367Q7RTV3 350 aa5.12□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 SATL1Q86VE3 508 aa5.12□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 Q8IYB0 196 aa5.12□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 SAXO1Q8IYX7 474 aa5.12□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 KIR3DL3Q8N743 410 aa5.12□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 TPRX1Q8N7U7 411 aa5.12□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 OR4S1Q8NGB4 309 aa5.12□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 OR10K1Q8NGX5 313 aa5.12□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 TMEM158Q8WZ71 300 aa5.12□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP5.12□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 MYDGFQ969H8 173 aa5.12□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 CYYR1Q96J86 154 aa5.12□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 DERL3Q96Q80 235 aa5.12□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 MND1Q9BWT6 205 aa5.12□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 SUCNR1Q9BXA5 334 aa5.12□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 FAM192AQ9GZU8 254 aa5.12□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
TTR-203ENST00000541025 SCN3BQ9NY72 215 aa5.12□□□□□ -1.59
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