RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532474.5

RCN1-208, Transcript of reticulocalbin 1, human

TSL 3

Gene RCN1, Length 714 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RCN1-208	ENST00000532474	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	GGH	Q92820	318 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	TOMM40L	Q969M1	308 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	FAM172BP	A6NC97	362 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	AIP	O00170	330 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	GLA	P06280	429 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	CD28	P10747	220 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	CEL	P19835	753 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	IL3RA	P26951	378 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	SSTR5	P35346	364 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	WNT4	P56705	351 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	CD83	Q01151	205 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	C6orf183	Q5T699	404 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	RNLS	Q5VYX0	342 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	AHSA2	Q719I0	299 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	NEK7	Q8TDX7	302 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	TFAP2C	Q92754	450 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	MYDGF	Q969H8	173 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	R3HDM4	Q96D70	268 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	DERL3	Q96Q80	235 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	OR14A2	Q96R54	314 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	OR5M11	Q96RB7	305 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	CST11	Q9H112	138 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	GHRL	Q9UBU3	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	PSG11	Q9UQ72	335 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	CCRL2	O00421	344 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	SPINT2	O43291	252 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	FGF16	O43320	207 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	TXNL1	O43396	289 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	LALBA	P00709	142 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	MT-ND4	P03905	459 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	LPL	P06858	475 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	GNAO1	P09471	354 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	UBB	P0CG47	229 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	TMEM11	P17152	192 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	CD24	P25063	80 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	SLC6A1	P30531	599 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	RANBP1	P43487	201 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	GPR50	Q13585	617 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	HES1	Q14469	280 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	STEAP3	Q658P3	488 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	AWAT2	Q6E213	333 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	LINC00311	Q8N616	119 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	COMMD1	Q8N668	190 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	DRAM1	Q8N682	238 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCN1-208	ENST00000532474	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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