RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531050.5

PTPRK-219, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRK, Length 2,515 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-219ENST00000531050 HCRTR1O43613 425 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 CELA3BP08861 270 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 POU2F2P09086 479 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 IGLL1P15814 213 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 CKS1BP61024 79 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 NTHL1P78549 312 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 RELBQ01201 579 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 BAXQ07812 192 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 IGFBP7Q16270 282 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 HIST3H3Q16695 136 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 PHYHD1Q5SRE7 291 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 FHL5Q5TD97 284 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 LCN12Q6JVE5 192 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 ASCL4Q6XD76 172 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 OR4N5Q8IXE1 308 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 OR2Z1Q8NG97 314 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 OR2V2Q96R30 315 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 HDAC8Q9BY41 377 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 RENP00797 406 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 HLA-DQA2P01906 255 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 CYC1P08574 325 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 AMTP48728 403 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 METAP1P53582 386 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 FMODQ06828 376 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 FAM53BQ14153 422 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 PDGFRLQ15198 375 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 HLA-BQ31612 363 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 Q6ZNB5 142 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 SGMS2Q8NHU3 365 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 ZNF721Q8TF20 911 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 KLHDC7BQ96G42 594 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 TMEM59Q9BXS4 323 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 GNB4Q9HAV0 340 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 WASHC3Q9Y3C0 194 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 A0A1W2PS18 150 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 ZNF878C9JN71 531 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 NUDT3O95989 172 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 HAND1O96004 215 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 CA2P00918 260 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 NRASP01111 189 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 KRASP01116 189 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 OR3A4PP47883 348 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 PHLDA2Q53GA4 152 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 EMC4Q5J8M3 183 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 STUMQ69YW2 141 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 ZNF547Q8IVP9 402 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 CMTM8Q8IZV2 173 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 SIGMAR1Q99720 223 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 APOOQ9BUR5 198 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 LRRC61Q9BV99 259 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 NPVFQ9HCQ7 196 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 POLR1DQ9Y2S0 133 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 GRXCR1A8MXD5 290 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 VSTM5A8MXK1 200 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 H0YJW9 148 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 CD5LO43866 347 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 ZNF205O95201 554 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 CGAP01215 116 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 REG1AP05451 166 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 ZNF728P0DKX0 622 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 PMCHP20382 165 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 NPPCP23582 126 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 S100GP29377 79 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 CD70P32970 193 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 OPRM1P35372 400 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 PLA2G5P39877 138 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 MDH2P40926 338 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 C22orf39Q6P5X5 142 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 OR8I2Q8N0Y5 310 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 GATAD1Q8WUU5 269 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 FOXQ1Q9C009 403 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 ZNF286AQ9HBT8 521 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 THYN1Q9P016 225 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 SCN2AQ99250 2005 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 GAGE10A6NGK3 116 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 C17orf112F2Z3M2 114 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 S1PR2O95136 353 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-219ENST00000531050 NPBWR2P48146 333 aa6.67□□□□□ -1.34
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