RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	GAMT	Q14353	236 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	RAB30	Q15771	203 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF726P1	Q15940	193 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	OR2T2	Q6IF00	324 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF695	Q8IW36	515 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	GAPT	Q8N292	157 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF525	Q8N782	197 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	OR5R1	Q8NH85	324 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	ADGRG7	Q96K78	797 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	SSX3	Q99909	188 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	WDR54	Q9H977	334 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	CEP290	O15078	2479 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746		A0A0G2JRQ6	117 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746		C9J4A7	227 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	DVL1	O14640	695 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC31A2	O15432	143 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	CYB5B	O43169	146 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	SCRG1	O75711	98 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	DFFB	O76075	338 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	IGKV1-39	P01597	117 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	OPN1MW	P04001	364 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	TK1	P04183	234 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	IGKV1D-39	P04432	117 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	UMOD	P07911	640 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	CELA2A	P08217	269 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	SCT	P09683	121 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	CTXN2	P0C2S0	81 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	PATE4	P0C8F1	98 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	RD3L	P0DJH9	198 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	DDT	P30046	118 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	IL2RG	P31785	369 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	CD200	P41217	278 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	RAC3	P60763	192 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	PCBD1	P61457	104 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	ARL16	Q0P5N6	197 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	PDCD1	Q15116	288 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	PCSK4	Q6UW60	755 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746		Q6ZRM9	215 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	SSX7	Q7RTT5	188 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	GGN	Q86UU5	652 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	CALHM1	Q8IU99	346 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	OR4X1	Q8NH49	305 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	GPR146	Q96CH1	333 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	OR6C1	Q96RD1	312 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	RAB40C	Q96S21	281 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	P2RX4	Q99571	388 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	STRADB	Q9C0K7	418 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		4.23	□□□□□ -1.73

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