RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514705.5

TSPAN17-208, Transcript of tetraspanin 17, human

TSL 2

Gene TSPAN17, Length 4,445 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSPAN17-208	ENST00000514705	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	OR10D3	Q8NH80	312 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705		K7ESF4	209 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	IGHE	P01854	428 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	CFHR1	Q03591	330 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	11.97	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	ABHD3	Q8WU67	409 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	LIME1	Q9H400	295 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705		V9GYS6	101 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	CA11	O75493	328 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	EXT1	Q16394	746 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	CALHM1	Q8IU99	346 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	VAX2	Q9UIW0	290 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	FAM166B	A8MTA8	275 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705		B4DEV8	164 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	TCAP	O15273	167 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705		Q3ZCU0	254 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	CCL1	P22362	96 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	COL19A1	Q14993	1142 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	M1AP	Q8TC57	530 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	SOD3	P08294	240 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	ICAM4	Q14773	271 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	LYPD6	Q86Y78	171 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	DEFB124	Q8NES8	71 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	LOXL4	Q96JB6	756 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	C18orf12	Q96KH6	178 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	B4GALT7	Q9UBV7	327 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TSPAN17-208	ENST00000514705	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		11.96	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	RAC3	P60763	192 aa		11.96	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		11.96	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	GLRX2	Q9NS18	164 aa		11.96	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	CEP250	Q9BV73	2442 aa		11.96	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	SPTBN2	O15020	2390 aa		11.96	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	GPR146	Q96CH1	333 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	GCM1	Q9NP62	436 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	NAT8	Q9UHE5	227 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	F2R	P25116	425 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	IL15RA	Q13261	267 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	FAM78B	Q5VT40	261 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	PROB1	E7EW31	1015 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	TNFSF15	O95150	251 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	MT-CO3	P00414	261 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	IGKV1D-12	P01611	117 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	IGHV2-70	P01814	119 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	LIF	P15018	202 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	BAGE3	Q86Y29	109 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	BAGE2	Q86Y30	109 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	GDF9	O60383	454 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	IGHV2-5	P01817	119 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	CST2	P09228	141 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	CA6	P23280	308 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	HOXC12	P31275	282 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	RBKS	Q9H477	322 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	SLC22A20	A6NK97	555 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	COX5A	P20674	150 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	IL11RA	Q14626	422 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TSPAN17-208	ENST00000514705	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		11.94	□□□□□ -0.5

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