RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-222	ENST00000514552	CTDSP2	O14595	271 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	GNGT2	O14610	69 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	SYNGR1	O43759	233 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	ARG1	P05089	322 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	CD28	P10747	220 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	CCL3L1	P16619	93 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	COX7A1	P24310	79 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	CD81	P60033	236 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	CDC42	P60953	191 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	ESRRG	P62508	458 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC35A2	P78381	396 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	MS4A2	Q01362	244 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	SNAPC1	Q16533	368 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	FAHD1	Q6P587	224 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	PP6455	Q8WZ26	134 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	NSL1	Q96IY1	281 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	CEP19	Q96LK0	163 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	UHRF2	Q96PU4	802 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	CHST5	Q9GZS9	411 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	CLN6	Q9NWW5	311 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552		A0A1B0GTI1	187 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552		M0QZK8	103 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC6A1	P30531	599 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	BRS3	P32247	399 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	CRISP1	P54107	249 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	CXCR4	P61073	352 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	ACTA2	P62736	377 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	ACTG2	P63267	376 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	ACTC1	P68032	377 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	ACTA1	P68133	377 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	BDH1	Q02338	343 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF146	Q15072	292 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	SSX2	Q16385	188 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	OR52W1	Q6IF63	320 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	ASRGL1	Q7L266	308 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	TCF23	Q7RTU1	214 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	GID4	Q8IVV7	300 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	POC5	Q8NA72	575 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF488	Q96MN9	340 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	RHOF	Q9HBH0	211 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	GPR173	Q9NS66	373 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	COPS3	Q9UNS2	423 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	RYR3	Q15413	4870 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	FUOM	A2VDF0	154 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	OOSP1	A8MZH6	123 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	FKBP6	O75344	327 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	SULT1C4	O75897	302 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	OR2F2	O95006	317 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	CLIC3	O95833	236 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	FAM107A	O95990	144 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	HAND1	O96004	215 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	SERPINA3	P01011	423 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	TFAP2A	P05549	437 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	KRT8	P05787	483 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	CSN2	P05814	226 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PDE4D-222	ENST00000514552	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55

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