RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506197.2

SMIM20-201, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMIM20, Length 935 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-201ENST00000506197 ARL11Q969Q4 196 aa16.51■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 OCSTAMPQ9BR26 566 aa16.51■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 TAF9BQ9HBM6 251 aa16.51■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa16.51■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa16.5■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 C12orf77C9JDV5 145 aa16.5■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 M0R1W7 72 aa16.5■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 IFNA2P01563 188 aa16.5■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 SSTR5P35346 364 aa16.5■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP16.5■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 OR52I2Q8NH67 350 aa16.5■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 TMEM160Q9NX00 188 aa16.5■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 KPTNQ9Y664 436 aa16.5■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 TRDCB7Z8K6 153 aa16.49■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 RBP4P02753 201 aa16.49■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 DGCR2P98153 550 aa16.49■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 HMGN3Q15651 99 aa16.49■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 Q6ZPA2 131 aa16.49■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 GVQW1Q8N7I0 195 aa16.49■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 SMIM4Q8WVI0 70 aa16.49■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 AKIP1Q9NQ31 210 aa16.49■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 C17orf98A8MV24 154 aa16.48■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 C15orf65H3BRN8 121 aa16.48■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 J3QLI3 93 aa16.48■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 RBBP9O75884 186 aa16.48■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 HBZP02008 142 aa16.48■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 FCER2P06734 321 aa16.48■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 FAM157CP0CG43 387 aa16.48■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 CGB3P0DN86 165 aa16.48■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 CGB7P0DN87 165 aa16.48■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 RCVRNP35243 200 aa16.48■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 DLX6P56179 175 aa16.48■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 ACTBP60709 375 aa16.48■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 ACTG1P63261 375 aa16.48■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF79Q15937 498 aa16.48■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 C17orf58Q2M2W7 97 aa16.48■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa16.48■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 Q6ZS49 121 aa16.48■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa16.48■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 HOGA1Q86XE5 327 aa16.48■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 BEST4Q8NFU0 473 aa16.48■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 RFESDQ8TAC1 157 aa16.48■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 UBALD1Q8TB05 177 aa16.48■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 FAHD2AQ96GK7 314 aa16.48■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa16.48■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 FABP7O15540 132 aa16.47■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 TOX4O94842 621 aa16.47■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 ARPC4P59998 168 aa16.47■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 ERVFRD-1P60508 538 aa16.47■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 PAX8Q06710 450 aa16.47■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF846Q147U1 533 aa16.47■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 LTC4SQ16873 150 aa16.47■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 TMEM30BQ3MIR4 351 aa16.47■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 HEPN1Q6WQI6 88 aa16.47■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 Q8N402 240 aa16.47■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 MFSD4AQ8N468 514 aa16.47■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 OR10A7Q8NGE5 316 aa16.47■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 OR4A4PQ8NGN8 299 aa16.47■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 OR1L1Q8NH94 360 aa16.47■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 IL1F10Q8WWZ1 152 aa16.47■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 GALMQ96C23 342 aa16.47■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 PCGF1Q9BSM1 259 aa16.47■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 BEX2Q9BXY8 128 aa16.47■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 SRRQ9GZT4 340 aa16.47■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 C7orf69Q9H7B7 122 aa16.47■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 MTFP1Q9UDX5 166 aa16.47■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 KCNS2Q9ULS6 477 aa16.47■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 AUP1Q9Y679 476 aa16.47■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa16.46■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 SCTP09683 121 aa16.46■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 IGHV1-8P0DP01 117 aa16.46■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 OMGP23515 440 aa16.46■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 FPR2P25090 351 aa16.46■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 NFYBP25208 207 aa16.46■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 OR52W1Q6IF63 320 aa16.46■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 GDPD1Q8N9F7 314 aa16.46■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 KIRREL1Q96J84 757 aa16.46■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 SIRPDQ9H106 197 aa16.46■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 LINC00574Q9H8X3 128 aa16.46■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 KLK11Q9UBX7 282 aa16.46■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 ANXA10Q9UJ72 324 aa16.46■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 ANAPC10Q9UM13 185 aa16.46■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 SESN1Q9Y6P5 492 aa16.46■□□□□ 0.23
SMIM20-201ENST00000506197 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
SMIM20-201ENST00000506197 GSTT2P0CG29 244 aa16.45■□□□□ 0.22
SMIM20-201ENST00000506197 GSTT2BP0CG30 244 aa16.45■□□□□ 0.22
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
SMIM20-201ENST00000506197 VMO1Q7Z5L0 202 aa16.45■□□□□ 0.22
SMIM20-201ENST00000506197 Q8N7P7 452 aa16.45■□□□□ 0.22
SMIM20-201ENST00000506197 SPATA3Q8NHX4 192 aa16.45■□□□□ 0.22
SMIM20-201ENST00000506197 SIRT7Q9NRC8 400 aa16.45■□□□□ 0.22
SMIM20-201ENST00000506197 GNG12Q9UBI6 72 aa16.45■□□□□ 0.22
SMIM20-201ENST00000506197 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa16.44■□□□□ 0.22
SMIM20-201ENST00000506197 F2RL2O00254 374 aa16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.5 ms