RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497648.1

RABGGTB-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,319 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-214ENST00000497648 NEIL2Q969S2 332 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 LRRC58Q96CX6 371 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 TIMD4Q96H15 378 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 ACY3Q96HD9 319 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 OR4K3Q96R72 315 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 PEBP4Q96S96 227 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 KXD1Q9BQD3 176 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 TMEM70Q9BUB7 260 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 LRRC61Q9BV99 259 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 OR51I2Q9H344 312 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 SLC25A19Q9HC21 320 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 DLL4Q9NR61 685 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 TPRKBQ9Y3C4 175 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa7.49□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 CROCCQ5TZA2 2017 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 KMT2EQ8IZD2 1858 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF292O60281 2723 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 SDK1Q7Z5N4 2213 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 DAPL1A0PJW8 107 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 PRSS29PA6NIE9 313 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 LRRC30A6NM36 301 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 PLPP1O14494 284 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 CDC42EP2O14613 210 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 FGF17O60258 216 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 AMY1AP04745 511 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 HPNP05981 417 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 SP9P0CG40 484 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 G6PCP35575 357 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 TSFMP43897 325 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 TGFBR3Q03167 851 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 ROM1Q03395 351 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 TAF10Q12962 218 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 PDGFRLQ15198 375 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 SLC25A26Q70HW3 274 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 TMEM219Q86XT9 240 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 OR4C13Q8NGP0 309 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 FBXO25Q8TCJ0 367 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 OR5P3Q8WZ94 311 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 TBX15Q96SF7 602 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 CDH20Q9HBT6 801 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 GALNT9Q9HCQ5 603 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 CCL26Q9Y258 94 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 PIEZO1Q92508 2521 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 A0A1B0GV50 99 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 A0A1W2PPI3 338 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 UBE2QL1A1L167 161 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 H0Y8X5 98 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 IFNL4K9M1U5 179 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 SAP18O00422 153 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 FFAR3O14843 346 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 GPR42O15529 346 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 FAM20BO75063 409 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 KBTBD11O94819 623 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 RENP00797 406 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 HPXP02790 462 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 CD3EP07766 207 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 SP1P08047 785 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 SOD3P08294 240 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 FAM106CPP0CH98 169 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 VSIG10L2P0DP72 767 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 ADCYAP1P18509 176 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 NFYBP25208 207 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 P2RY1P47900 373 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 RPL31P62899 125 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 BTG2P78543 158 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 FMODQ06828 376 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 IL10RBQ08334 325 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 BATFQ16520 125 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 FAM106AQ4KMX7 169 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 TMEM215Q68D42 235 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 PRSS45Q7RTY3 260 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 GCSAMQ8N6F7 178 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 SUMF2Q8NBJ7 301 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 SYT8Q8NBV8 401 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 OR51A2Q8NGJ7 313 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 THEM6Q8WUY1 208 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 WBP2Q969T9 261 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 BORCS7Q96B45 105 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 KCNIP1Q9NZI2 227 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-214ENST00000497648 ANXA10Q9UJ72 324 aa7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.3 ms