RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	LRTM2	Q8N967	370 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	UBALD1	Q8TB05	177 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	LINC01560	Q8TB33	94 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	PKIB	Q9C010	78 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	PROCR	Q9UNN8	238 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	HEATR1	Q9H583	2144 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	SVIL	O95425	2214 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	LOC105371267	A0A1B0GV96	52 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	TRDC	B7Z8K6	153 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730		F8W735	103 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730		J3QT63	122 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	SIRPB1	O00241	398 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	HSD17B6	O14756	317 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	HS3ST1	O14792	307 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	MPPED1	O15442	326 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	DEDD	O75618	318 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	DIRAS3	O95661	229 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	IGKV1-39	P01597	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	IGLV2-14	P01704	120 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	IGKV1D-39	P04432	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	CBR1	P16152	277 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	ADCYAP1	P18509	176 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	ECI1	P42126	302 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	ARHGDIB	P52566	201 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	RND3	P61587	244 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	GNG3	P63215	75 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	NAAA	Q02083	359 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	IL13RA2	Q14627	380 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	MPV17L	Q2QL34	196 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730		Q6ZT83	130 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC35G3	Q8N808	338 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	TMED6	Q8WW62	240 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	LRRC46	Q96FV0	321 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	C5orf30	Q96GV9	206 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	BOD1	Q96IK1	185 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	ARV1	Q9H2C2	271 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	PIGM	Q9H3S5	423 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	JKAMP	Q9P055	326 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	FZR1	Q9UM11	496 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	SPTA1	P02549	2419 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	OR5B21	A6NL26	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730		C9JQL5	133 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	C16orf97	H3BN30	126 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	CDIPT	O14735	213 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	BET1	O15155	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM50A	O95807	157 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	OR2H2	O95918	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	SCGB1D2	O95969	90 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	IGKV3-15	P01624	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	IGLV1-44	P01699	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	GLA	P06280	429 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	CECR9	P0C854	216 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	PGA5	P0DJD9	388 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	EGR1	P18146	543 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	LMO1	P25800	156 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	LPAR6	P43657	344 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	ASCL1	P50553	236 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C4BPB-208	ENST00000492730	UCP2	P55851	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.2 ms