RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490322.1

SMYD3-215, Transcript of SET and MYND domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMYD3, Length 368 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3-215ENST00000490322 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 NOX3Q9HBY0 568 aa2.4□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 IFT46Q9NQC8 304 aa2.4□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 B3GNT2Q9NY97 397 aa2.4□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 CLCF1Q9UBD9 225 aa2.4□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 KLK13Q9UKR3 277 aa2.4□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 ING4Q9UNL4 249 aa2.4□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 SLC7A11Q9UPY5 501 aa2.4□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa2.4□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 CEP295Q9C0D2 2601 aa2.4□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 SPTBN4Q9H254 2564 aa2.4□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 ASPMQ8IZT6 3477 aa2.4□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 LOC400499M0QZD8 3231 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 PRR14LQ5THK1 2151 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 SHANK1Q9Y566 2161 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 DOCK11Q5JSL3 2073 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 A0A0A6YYD4 124 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 A0A0U1RRA0 63 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 A0A1W2PPI3 338 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 TMEM235A6NFC5 223 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 ZNF850A8MQ14 1090 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 SNRPGP15A8MWD9 76 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 MFNGO00587 321 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 CCSO14618 274 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 SOCS1O15524 211 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 CA11O75493 328 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 LYZL6O75951 148 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 NRASP01111 189 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 CRYABP02511 175 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 C1QBP02746 253 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 CD3DP04234 171 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 IL5P05113 134 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 CSN2P05814 226 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 FCER2P06734 321 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 MELTFP08582 738 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 SFTPCP11686 197 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 ANXA3P12429 323 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 GP9P14770 177 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 DAOP14920 347 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 MGMTP16455 207 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 GNB3P16520 340 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 TBPP20226 339 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 GABRR1P24046 479 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 ACKR3P25106 362 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 PTGFRP43088 359 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 CBX5P45973 191 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 HERV-K104P61576 105 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 FAM3AP98173 230 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 PRDX4Q13162 271 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 ARFRP1Q13795 201 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 ZMYND11Q15326 602 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 FCN2Q15485 313 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 TWIST1Q15672 202 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 KCNJ8Q15842 424 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 TBC1D28Q2M2D7 210 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 CDNFQ49AH0 187 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 HIKESHIQ53FT3 197 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 ACTBL2Q562R1 376 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 TMEM255AQ5JRV8 349 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 C1orf185Q5T7R7 199 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 TMEM42Q69YG0 159 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 RTL6Q6ICC9 239 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 FAAP20Q6NZ36 180 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 GFRALQ6UXV0 394 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 TFAP2EQ6VUC0 442 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 Q6ZS92 163 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 Q6ZT83 130 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 IL17RELQ6ZVW7 336 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 COX8CQ7Z4L0 72 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 MDP1Q86V88 176 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 TMEM219Q86XT9 240 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 ODF3L1Q8IXM7 274 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 CCDC36Q8IYA8 594 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 OSR2Q8N2R0 312 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 BPIFB2Q8N4F0 458 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 C9orf106Q8NAJ2 232 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 TMEM104Q8NE00 496 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 SLC30A7Q8NEW0 376 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 OR56B2PQ8NGI1 322 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 OR51S1Q8NGJ8 323 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 OR5L1Q8NGL2 311 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 OR5M9Q8NGP3 310 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 OR10K1Q8NGX5 313 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 PIGCQ92535 297 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 CMBLQ96DG6 245 aa2.39□□□□□ -2.03
SMYD3-215ENST00000490322 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms