RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 GPR157Q5UAW9 335 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 C1QL2Q7Z5L3 287 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 SLC35E1Q96K37 410 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM56Q96MV1 263 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 TM2D1Q9BX74 207 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 OR51I2Q9H344 312 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 FKBP11Q9NYL4 201 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 TAS2R3Q9NYW6 316 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 C1RLQ9NZP8 487 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 A0A1W2PRD5 423 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 A0A1W2PRF3 423 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 A0A1W2PRM7 423 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 K7N7A8 449 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 FOXH1O75593 365 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 THBS3P49746 956 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 CLINT1Q14677 625 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 SPANXN5Q5MJ07 72 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 OR8G2PQ6IF36 304 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 GAPTQ8N292 157 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 SLA2Q9H6Q3 261 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 CCL28Q9NRJ3 127 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 CALYQ9NYX4 217 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 MTCH1Q9NZJ7 389 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 A0A0G2JK05 382 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 WNT9BO14905 357 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 RAB29O14966 203 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 OR5AC1P0C628 307 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 PPIAL4GP0DN37 164 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 RRASP10301 218 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 HNF1AP20823 631 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 SSTR2P30874 369 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 CD200P41217 278 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 BAXQ07812 192 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 SLC2A9Q9NRM0 540 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 A0A0B4J2A0 478 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 SSSCA1O60232 199 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 TSPAN15O95858 294 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 PGA5P0DJD9 388 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 SLC35E4Q6ICL7 350 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 TBC1D26Q86UD7 250 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 OR10P1Q8NGE3 313 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 SHPKQ9UHJ6 478 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 LOC105371242A0A075B767 164 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 B8ZZF3 427 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 MFNGO00587 321 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 C1QBP02746 253 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 LIPFP07098 398 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 S100A11P31949 105 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 UNC119Q13432 240 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 OPCMLQ14982 345 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 C3orf36Q3SXR2 165 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 SSC4DQ8WTU2 575 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 GON7Q9BXV9 100 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 PLSCR2Q9NRY7 297 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 FBLN5Q9UBX5 448 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 F2RL2O00254 374 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 PLA2G10O15496 165 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 SPNP16150 400 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM33P57088 247 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 MPPED2Q15777 294 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 FAM168AQ92567 244 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 CORO2AQ92828 525 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRD-211ENST00000486161 CENPFP49454 3210 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 PCNTO95613 3336 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 LANCL1O43813 399 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 OR2F2O95006 317 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 CRYBA1P05813 215 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 OR2F1Q13607 317 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 C20orf204Q6ZNR8 217 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 SDSLQ96GA7 329 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 GHITMQ9H3K2 345 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 TAAR5O14804 337 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 FBXO24O75426 580 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 CRYZL1O95825 349 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 SCTP09683 121 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 NCMAPQ5T1S8 102 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 SLC51BQ86UW2 128 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 SLC25A42Q86VD7 318 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 ZNRF1Q8ND25 227 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 Q9N2K0 584 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 PSENENQ9NZ42 101 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 JPT1Q9UK76 154 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 IGHV1-46P01743 117 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRD-211ENST00000486161 FGF2P09038 288 aa7.02□□□□□ -1.29
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