RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463372.5

C9orf3-211, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 919 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-211ENST00000463372 DEGS1O15121 323 aa9.72□□□□□ -0.85
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF137PP52743 207 aa9.72□□□□□ -0.85
C9orf3-211ENST00000463372 OR5T1Q8NG75 326 aa9.72□□□□□ -0.85
C9orf3-211ENST00000463372 OR52M1Q8NGK5 317 aa9.72□□□□□ -0.85
C9orf3-211ENST00000463372 GALNT14Q96FL9 552 aa9.72□□□□□ -0.85
C9orf3-211ENST00000463372 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
C9orf3-211ENST00000463372 SPAG4Q9NPE6 437 aa9.72□□□□□ -0.85
C9orf3-211ENST00000463372 UBQLN2Q9UHD9 624 aa9.72□□□□□ -0.85
C9orf3-211ENST00000463372 GAB2Q9UQC2 676 aa9.72□□□□□ -0.85
C9orf3-211ENST00000463372 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa9.71□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 DHRS7CA6NNS2 312 aa9.71□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 MPTX1A8MV57 137 aa9.71□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 FAM229AH3BQW9 127 aa9.71□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 BMPR1BO00238 502 aa9.71□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 FCN1O00602 326 aa9.71□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 DEFA5Q01523 94 aa9.71□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa9.71□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 Q6P435 159 aa9.71□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 C6orf223Q8N319 242 aa9.71□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 OR2C3Q8N628 320 aa9.71□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 OR14K1Q8NGZ2 314 aa9.71□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 USMG5Q96IX5 58 aa9.71□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 HSH2DQ96JZ2 352 aa9.71□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 TAS2R1Q9NYW7 299 aa9.71□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa9.71□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 RRHO14718 337 aa9.7□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 LANCL1O43813 399 aa9.7□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 GATBO75879 557 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 TTRP02766 147 aa9.7□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 CBLN1P23435 193 aa9.7□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 ADMP35318 185 aa9.7□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 MAP2K4P45985 399 aa9.7□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 NUDT2P50583 147 aa9.7□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 ATP1B3P54709 279 aa9.7□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 KRTAP10-2P60368 255 aa9.7□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 UBE2V2Q15819 145 aa9.7□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 Q6ZSN1 163 aa9.7□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa9.7□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 OR8J3Q8NGG0 315 aa9.7□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 CACNG8Q8WXS5 425 aa9.7□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 OTULINQ96BN8 352 aa9.7□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 C17orf77Q96MU5 243 aa9.7□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 CSTL1Q9H114 145 aa9.7□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 GFOD1Q9NXC2 390 aa9.7□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa9.69□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 TRAV39A0A0B4J263 110 aa9.69□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 FAM220BPB1ANY3 271 aa9.69□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 SLC31A2O15432 143 aa9.69□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 HTR3BO95264 441 aa9.69□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 IGHV3-43DP0DP04 118 aa9.69□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 IFNGR2P38484 337 aa9.69□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 RBP2P50120 134 aa9.69□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 XGP55808 180 aa9.69□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF767PQ75MW2 155 aa9.69□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 C5orf24Q7Z6I8 188 aa9.69□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 OR2T12Q8NG77 320 aa9.69□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 CLCC1Q96S66 551 aa9.69□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 MROQ9BYG7 248 aa9.69□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 MLXQ9UH92 298 aa9.69□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 CDH10Q9Y6N8 788 aa9.69□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 SELENOFO60613 162 aa9.68□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 IFNGP01579 166 aa9.68□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 GZMHP20718 246 aa9.68□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 GSSP48637 474 aa9.68□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 Q3ZCU0 254 aa9.68□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 RNF212Q495C1 297 aa9.68□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF562Q6V9R5 426 aa9.68□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa9.68□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 GRPEL2Q8TAA5 225 aa9.68□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 ARL11Q969Q4 196 aa9.68□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 MED20Q9H944 212 aa9.68□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 PTTG2Q9NZH5 202 aa9.68□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 LAMP5Q9UJQ1 280 aa9.68□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 TRAV25A0A0B4J276 109 aa9.67□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 RIIAD1A6NNX1 92 aa9.67□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 H0YJX3 145 aa9.67□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 SERPINA3P01011 423 aa9.67□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF3P17036 446 aa9.67□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 LGALS7P47929 136 aa9.67□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 MTCP1P56278 107 aa9.67□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 TSPAN31Q12999 210 aa9.67□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 METTL21CQ5VZV1 264 aa9.67□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 DEGS2Q6QHC5 323 aa9.67□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa9.67□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 ASB9Q96DX5 294 aa9.67□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 FUZQ9BT04 418 aa9.67□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 CCDC28BQ9BUN5 200 aa9.67□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 RNF167Q9H6Y7 350 aa9.67□□□□□ -0.86
C9orf3-211ENST00000463372 TGOLN2O43493 480 aa9.66□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms