RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415055.2

PTPRK-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-210ENST00000415055 SNAI3Q3KNW1 292 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 MESTQ5EB52 335 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 GLYATL3Q5SZD4 288 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 AGBL2Q5U5Z8 902 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 Q6ZRG5 221 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
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PTPRK-210ENST00000415055 C11orf53Q8IXP5 236 aa3.5□□□□□ -1.85
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PTPRK-210ENST00000415055 OR4Q3Q8NH05 313 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 OR5K1Q8NHB7 308 aa3.5□□□□□ -1.85
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PTPRK-210ENST00000415055 ZNF426Q9BUY5 554 aa3.5□□□□□ -1.85
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PTPRK-210ENST00000415055 USE1Q9NZ43 259 aa3.5□□□□□ -1.85
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PTPRK-210ENST00000415055 UBDO15205 165 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 TNFSF12O43508 249 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 TSC22D2O75157 780 aa3.49□□□□□ -1.85
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PTPRK-210ENST00000415055 CD14P08571 375 aa3.49□□□□□ -1.85
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PTPRK-210ENST00000415055 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP3.49□□□□□ -1.85
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PTPRK-210ENST00000415055 OR1E2P47887 323 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 PPT1P50897 306 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 DYNLT3P51808 116 aa3.49□□□□□ -1.85
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PTPRK-210ENST00000415055 GPR148Q8TDV2 347 aa3.49□□□□□ -1.85
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PTPRK-210ENST00000415055 SORT1Q99523 831 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 TM2D3Q9BRN9 247 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 COPS4Q9BT78 406 aa3.49□□□□□ -1.85
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PTPRK-210ENST00000415055 XRCC2O43543 280 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 BUB3O43684 328 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 CIDEAO60543 219 aa3.48□□□□□ -1.85
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PTPRK-210ENST00000415055 SPNP16150 400 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF823P16415 610 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 MT3P25713 68 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 HTR1DP28221 377 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 CRABP1P29762 137 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 DDOSTP39656 456 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 YAP1P46937 504 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PTPRK-210ENST00000415055 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
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