RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR10W1Q8NGF6 305 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 UBA3Q8TBC4 463 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 FNDC9Q8TBE3 224 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC7A13Q8TCU3 470 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 C4orf3Q8WVX3 66 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAAP24Q9BTP7 215 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 CHID1Q9BWS9 393 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 BCL9LQ86UU0 1499 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 MIA3Q5JRA6 1907 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 FREM3P0C091 2139 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 NBEAQ8NFP9 2946 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 SOGA1O94964 1423 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRAV7A0A075B6U4 112 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A087WUU8 490 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A096LNT2 108 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 CFAP73A6NFT4 308 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCDC160A6NGH7 325 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRIM64A6NGJ6 449 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRIM64BA6NI03 449 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 SMKR1H3BMG3 65 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 UBE2CO00762 179 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 SDHDO14521 159 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR2F2O95006 317 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 DIRAS3O95661 229 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 AGR2O95994 175 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 CT45A6P0DMU7 189 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 CT45A5P0DMU8 189 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 CT45A7P0DMV0 189 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 DEFA4P12838 97 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 PSMB8P28062 276 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 OPRM1P35372 400 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 CRATP43155 626 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPICP45877 212 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 TSPEAR-AS2P59090 65 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 HTD2P86397 168 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 SEMG2Q02383 582 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPATA45Q537H7 98 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 CT45A1Q5HYN5 189 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 C1orf137Q5JT78 98 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 STEAP4Q687X5 459 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 NIPAL3Q6P499 406 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 KCNIP4Q6PIL6 250 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 NIPA1Q7RTP0 329 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 CT45A3Q8NHU0 189 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM106AQ96A25 262 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 TESCQ96BS2 214 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 MIXL1Q9H2W2 232 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 RIBC2Q9H4K1 309 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 B9D1Q9UPM9 204 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 DNAH1Q9P2D7 4330 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 BICRAQ9NZM4 1560 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 MYO7BQ6PIF6 2116 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 SCN3AQ9NY46 2000 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 SACSQ9NZJ4 4579 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRAV34A0A0B4J273 112 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 LYRM9A8MSI8 78 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 C21orf140B9A014 251 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 BTN3A3O00478 584 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC16A7O60669 478 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 CLIC3O95833 236 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 LDHAP00338 332 aaKnown RBP-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 PGA4P0DJD7 388 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 PGA3P0DJD8 388 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 PGA5P0DJD9 388 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCL3P10147 92 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 RALBP11234 206 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 NT5EP21589 574 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 LAP3P28838 519 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRDX6P30041 224 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 MDH1P40925 334 aaKnown RBP-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 TPI1P60174 286 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 BTN3A2P78410 334 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 AARDQ4LEZ3 155 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 GLT8D1Q68CQ7 371 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 REEP3Q6NUK4 255 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 APRG1Q8IVJ8 170 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 REEP6Q96HR9 211 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRR15LQ9BU68 103 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 ASB7Q9H672 318 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 INSIG2Q9Y5U4 225 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 CEP295Q9C0D2 2601 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 KIF24Q5T7B8 1368 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A0C4DFX4 3053 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 SIRPB1O00241 398 aa-2.51□□□□□ -2.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms