RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409251.7

PTPRN-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-202ENST00000409251 CRYAAP02489 173 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 SPINK9Q5DT21 86 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 DCAF12Q5T6F0 453 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 VN1R17PQ8TDU5 208 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 TMEM234Q8WY98 164 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 PTX4Q96A99 478 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 MALSU1Q96EH3 234 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 UCN2Q96RP3 112 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 SAMD10Q9BYL1 202 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 RBKSQ9H477 322 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 HSPB2A8KAH6 182 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 HSPB2Q16082 182 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 FAM78BQ5VT40 261 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 SPSB3Q6PJ21 355 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 BOD1Q96IK1 185 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 C2orf88Q9BSF0 95 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 TMEM208Q9BTX3 173 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 ALKBH4Q9NXW9 302 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 AKAP13Q12802 2813 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 ZNF92Q03936 586 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 TMEM187Q14656 261 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 ADAM19Q9H013 955 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 FREM1Q5H8C1 2179 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 DXOO77932 396 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 ISG15P05161 165 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 SERPINE2P07093 398 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 TDGF1P13385 188 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 MPZP25189 248 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 DPPA3Q6W0C5 159 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 Q6ZVH6 145 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 LHFPL1Q86WI0 220 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 TMEM183AQ8IXX5 376 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 PGPEP1LA6NFU8 196 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 SERPINE3A8MV23 424 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 RAB4BP61018 213 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 TBC1D26Q86UD7 250 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 C1QL4Q86Z23 238 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 TMEM256Q8N2U0 113 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 GATAD1Q8WUU5 269 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 SCRT1Q9BWW7 348 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 METTL9Q9H1A3 318 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 FGF5P12034 268 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 ARL6IP1Q15041 203 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 DOK3Q7L591 496 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 CBY3A6NI87 242 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 LRRC3CA6NJW4 275 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 SIAH2O43255 324 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 PMELP40967 661 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 OR3A1P47881 315 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 KRTDAPP60985 99 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 PCOLCEQ15113 449 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 IQCJQ1A5X6 159 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 TCF23Q7RTU1 214 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 ZNF709Q8N972 641 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 NEU1Q99519 415 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 SLC7A10Q9NS82 523 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 NOTCH3Q9UM47 2321 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 BTF3P20290 206 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 IL15RAQ13261 267 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 GAPTQ8N292 157 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 CLDND2Q8NHS1 167 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 BTF3L4Q96K17 158 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 ATP5SQ99766 215 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 IRF2P14316 349 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 SELEP16581 610 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 BSXQ3C1V8 233 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 TDRG1Q3Y452 100 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 SLC23A3Q6PIS1 610 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 ZNF441Q8N8Z8 693 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 CT55Q8WUE5 264 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 DDIT4LQ96D03 193 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 DIRC2Q96SL1 478 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 PRSS50Q9UI38 385 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 IGF2RP11717 2491 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 FAM166BA8MTA8 275 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 PROB1E7EW31 1015 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 IL13RA2Q14627 380 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 SLC16A14Q7RTX9 510 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRN-202ENST00000409251 TMED3Q9Y3Q3 217 aa11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms