RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401088.8

SZRD1-201, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SZRD1, Length 3,636 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-201ENST00000401088 PDLIM4P50479 330 aa10.63□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 FOXF1Q12946 379 aa10.63□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 IL1F10Q8WWZ1 152 aa10.63□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 ELSPBP1Q96BH3 223 aa10.63□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 GABRG3Q99928 467 aa10.63□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 RNF186Q9NXI6 227 aa10.63□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 LHFPL6Q9Y693 200 aa10.63□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 C11orf94C9JXX5 98 aa10.63□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 MS4A18H0YCH9 400 aa10.63□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 M0QZ24 198 aa10.63□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 DHRS3O75911 302 aa10.63□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 WISP1O95388 367 aa10.63□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 NRASP01111 189 aa10.63□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 KRASP01116 189 aa10.63□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 TCN2P20062 427 aa10.63□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 RPS16P62249 146 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 LCN2P80188 198 aa10.63□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 SERF2P84101 59 aa10.63□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 MS4A18Q3C1V0 323 aa10.63□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 C9orf50Q5SZB4 431 aa10.63□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 SFTPA2Q8IWL1 248 aa10.63□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 KCNS2Q9ULS6 477 aa10.63□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 TMEM50AO95807 157 aa10.62□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 ADMP35318 185 aa10.62□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 HHEXQ03014 270 aa10.62□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 FBLN7Q53RD9 439 aa10.62□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 OR10G9Q8NGN4 311 aa10.62□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 OR10G7Q8NGN6 311 aa10.62□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 OR1K1Q8NGR3 316 aa10.62□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 WNT10AQ9GZT5 417 aa10.62□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 NPIPA2E9PIF3 369 aa10.62□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 TMEM250H0YL14 139 aa10.62□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 LILRA6Q6PI73 481 aa10.62□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 Q6ZWC4 215 aa10.62□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 ORAOV1Q8WV07 137 aa10.62□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 ZBP1Q9H171 429 aa10.62□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 CACNG5Q9UF02 275 aa10.62□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 TBX21Q9UL17 535 aa10.62□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 A0A1W2PPV4 95 aa10.62□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 ALG1L2C9J202 215 aa10.62□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 CBR3O75828 277 aa10.62□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 TDGF1P13385 188 aa10.62□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 PRR27Q6MZM9 219 aa10.62□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 OSR2Q8N2R0 312 aa10.62□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa10.62□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 NUDT10Q8NFP7 164 aa10.62□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 OR10V1Q8NGI7 309 aa10.62□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 RNF2Q99496 336 aa10.62□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 PYGO2Q9BRQ0 406 aa10.62□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 CCL28Q9NRJ3 127 aa10.62□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 FRG2CA6NGY1 282 aa10.61□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 H3BMH7 237 aa10.61□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 MPLP40238 635 aa10.61□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 GABRA2P47869 451 aa10.61□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 MYBPHQ13203 477 aa10.61□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 FNDC7Q5VTL7 733 aa10.61□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 C9orf40Q8IXQ3 194 aa10.61□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 OR2AE1Q8NHA4 323 aa10.61□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 PIGCQ92535 297 aa10.61□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 Q96M66 194 aa10.61□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 MYO7BQ6PIF6 2116 aa10.61□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 A0A1W2PNR3 127 aa10.61□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 FAM166BA8MTA8 275 aa10.61□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 A8MXE2 369 aa10.61□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 SYNGR2O43760 224 aa10.61□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 OTX2P32243 289 aa10.61□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 IER3P46695 156 aa10.61□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 THBS3P49746 956 aa10.61□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 GATAD1Q8WUU5 269 aa10.61□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 SPTSSAQ969W0 71 aa10.61□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF581Q9P0T4 197 aa10.61□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 M0R135 149 aa10.6□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 SLC38A11Q08AI6 406 aa10.6□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 CLEC2AQ6UVW9 174 aa10.6□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa10.6□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 LYG1Q8N1E2 194 aa10.6□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 SLC37A2Q8TED4 501 aa10.6□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 MBD3L1Q8WWY6 194 aa10.6□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF799Q96GE5 643 aa10.6□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 OR4C12Q96R67 309 aa10.6□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 NAT8BQ9UHF3 227 aa10.6□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 EML5Q05BV3 1969 aa10.6□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 CLEC18AA5D8T8 446 aa10.6□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 SNURFLB1AK76 121 aa10.6□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa10.6□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 NDUFB4O95168 129 aa10.6□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 IFI6P09912 130 aa10.6□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 COX5AP20674 150 aa10.6□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 TNFSF4P23510 183 aa10.6□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 SHBQ15464 509 aa10.6□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 EXT1Q16394 746 aa10.6□□□□□ -0.71
SZRD1-201ENST00000401088 CLEC18CQ8NCF0 446 aa10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms