RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393310.5

LIMS1-203, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-203ENST00000393310 GABRA4P48169 554 aa7□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 CEACAM7Q14002 265 aa7□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 KCNMB1Q16558 191 aa7□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 ADNP2Q6IQ32 1131 aa7□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 ZNF788Q6ZQV5 615 aa7□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 SIAH3Q8IW03 269 aa7□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 OR52P1PQ8NH57 321 aa7□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 ZNF519Q8TB69 540 aa7□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 LHX4Q969G2 390 aa7□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 HRASLS5Q96KN8 279 aa7□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 CABLES2Q9BTV7 478 aa7□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 OR4C46A6NHA9 309 aa7□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 OR11H12B2RN74 326 aa7□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 RGS11O94810 467 aa7□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 LCATP04180 440 aa7□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 NBEAP1P0C6P0 100 aa7□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 AADACP22760 399 aa7□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 ZNF136P52737 540 aa7□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 CLDN20P56880 219 aa7□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 RHOBP62745 196 aa7□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 ZNF730Q6ZMV8 503 aa7□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 CYS1Q717R9 158 aa7□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 OR11H1Q8NG94 326 aa7□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 OR11H2Q8NH07 326 aa7□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 FAM213BQ8TBF2 198 aa7□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 STARD4Q96DR4 205 aa7□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 SIGLEC11Q96RL6 698 aa7□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa7□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 A8MXK9 166 aa7□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 SPRY3O43610 288 aa7□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 CA11O75493 328 aa7□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 NGFRP08138 427 aa7□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 SSTR1P30872 391 aa7□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 FOXF1Q12946 379 aa7□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 CDK5R2Q13319 367 aa7□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 GINS1Q14691 196 aa7□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 RPEL1Q2QD12 228 aa7□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 FAM27D1Q5T7N8 215 aa7□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 COLCA1Q6ZS62 124 aa7□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 OR4K5Q8NGD3 323 aa7□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 OR5B3Q8NH48 314 aa7□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 WDFY2Q96P53 400 aa7□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 A0A1W2PRS3 328 aa6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 ISLRO14498 428 aa6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 EMDP50402 254 aa6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 HBA1P69905 142 aa6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 PIGFQ07326 219 aa6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 ADPRMQ3LIE5 342 aa6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 DMRTC1Q5HYR2 192 aa6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 OR51A4Q8NGJ6 313 aa6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 ZNF721Q8TF20 911 aa6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 MOB3AQ96BX8 217 aa6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 TMEM70Q9BUB7 260 aa6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 LRRK1Q38SD2 2015 aa6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 IFI6P09912 130 aa6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 GLRXP35754 106 aa6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 KRTDAPP60985 99 aa6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 ZNF620Q6ZNG0 422 aa6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 LYG2Q86SG7 212 aa6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 OR52B4Q8NGK2 314 aa6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 OR10C1Q96KK4 312 aa6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 ZNF442Q9H7R0 627 aa6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 WASHC3Q9Y3C0 194 aa6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 CSAG2Q9Y5P2 127 aa6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 A0A1W2PS29 197 aa6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 A8MWP6 167 aa6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 SNNO75324 88 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 PMS2P2O95744 297 aa6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 CD74P04233 296 aa6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 NMBP08949 121 aa6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 FABP2P12104 132 aa6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 HTR1FP30939 366 aa6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 IL2RGP31785 369 aa6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 UFM1P61960 85 aa6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 PYY3Q5JQD4 70 aa6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 AWAT2Q6E213 333 aa6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 NICN1Q9BSH3 213 aa6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 PRSS22Q9GZN4 317 aa6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 MSL2Q9HCI7 577 aa6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 ANK1P16157 1881 aa6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 C7orf71A4D174 169 aa6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 GAGE12JA6NER3 117 aa6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 DHRS7CA6NNS2 312 aa6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 TRIOO75962 3097 aa6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 SNCGO76070 127 aa6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 GAGE7O76087 117 aa6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 HPRT1P00492 218 aa6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 SFTA3P0C7M3 94 aa6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 GAGE12FP0CL80 117 aa6.99□□□□□ -1.29
LIMS1-203ENST00000393310 GAGE12GP0CL81 117 aa6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms